More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3632 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
433 aa  855    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  58.16 
 
 
442 aa  461  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  57.97 
 
 
405 aa  448  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1057  major facilitator superfamily MFS_1  64.69 
 
 
424 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  58.55 
 
 
431 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  56.2 
 
 
433 aa  430  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  59.31 
 
 
424 aa  428  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  57.04 
 
 
442 aa  425  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  56.6 
 
 
472 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  54.59 
 
 
438 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  50.61 
 
 
428 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  51.01 
 
 
433 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  49.75 
 
 
427 aa  341  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  48.21 
 
 
441 aa  341  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  48.77 
 
 
427 aa  338  9e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  48.15 
 
 
427 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  50 
 
 
428 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2897  major facilitator transporter  49.62 
 
 
427 aa  333  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388241  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3171  major facilitator transporter  49.37 
 
 
427 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  49.37 
 
 
427 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2806  transporter, putative  49.37 
 
 
427 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0029  major facilitator transporter  49.37 
 
 
427 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1737  major facilitator transporter  49.37 
 
 
427 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  49.12 
 
 
427 aa  332  9e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3626  major facilitator transporter  49.25 
 
 
427 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3613  monocarboxylate MFS permease  49.37 
 
 
427 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0473  major facilitator transporter  49.62 
 
 
427 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.472982 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  47.7 
 
 
430 aa  329  5.0000000000000004e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  47.47 
 
 
430 aa  329  5.0000000000000004e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  50.79 
 
 
432 aa  329  7e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0500  major facilitator transporter  48.66 
 
 
427 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0405  major facilitator transporter  49.37 
 
 
427 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0431  major facilitator transporter  49.37 
 
 
427 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.592654  normal  0.379231 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  52.04 
 
 
435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3588  major facilitator transporter  49.62 
 
 
427 aa  327  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.94844  normal  0.904194 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2605  major facilitator transporter  48.41 
 
 
427 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  47.06 
 
 
429 aa  326  6e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03015  putative transport transmembrane protein  47.67 
 
 
432 aa  325  9e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.120422 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3966  major facilitator superfamily MFS_1  48.11 
 
 
432 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  0.02436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  48.11 
 
 
432 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  47.63 
 
 
457 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  49.49 
 
 
429 aa  322  7e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  49.5 
 
 
428 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  49.12 
 
 
427 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  49.61 
 
 
425 aa  319  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0305  major facilitator superfamily MFS_1  51.05 
 
 
432 aa  319  7e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382232  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  48.37 
 
 
427 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  45.98 
 
 
431 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  48.03 
 
 
418 aa  317  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  46.27 
 
 
431 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  45.78 
 
 
435 aa  299  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  47.79 
 
 
436 aa  296  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  47.79 
 
 
437 aa  293  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  47.86 
 
 
427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 
409 aa  268  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  40.8 
 
 
422 aa  246  4e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  31.17 
 
 
405 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  28.28 
 
 
414 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  28.39 
 
 
436 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  29.95 
 
 
403 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  29.21 
 
 
402 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  29.65 
 
 
414 aa  134  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  27.45 
 
 
406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  29.25 
 
 
452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 
452 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  28.07 
 
 
406 aa  126  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  29.26 
 
 
412 aa  125  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  28.33 
 
 
407 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  27.55 
 
 
406 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  28.54 
 
 
404 aa  123  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  28.67 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  28.79 
 
 
413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  29.49 
 
 
528 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  29.93 
 
 
417 aa  121  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  29.07 
 
 
417 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  27.84 
 
 
400 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  27.32 
 
 
400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  27.34 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  28.93 
 
 
415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  27.59 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  29.01 
 
 
427 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  29.15 
 
 
402 aa  117  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  29.02 
 
 
412 aa  117  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  27.25 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  27.87 
 
 
404 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  29.3 
 
 
414 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  28.67 
 
 
408 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  26.93 
 
 
404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 
405 aa  113  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  28.97 
 
 
417 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  28.97 
 
 
417 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  28.97 
 
 
417 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  28.97 
 
 
417 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  28.57 
 
 
414 aa  111  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  28.97 
 
 
417 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  28.97 
 
 
417 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  28.09 
 
 
416 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  27.01 
 
 
410 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  27.03 
 
 
402 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>