More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2923 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 438 aa  840    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  64.9 
 
 		 442 aa  481  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  62.16 
 
 		 472 aa  472  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  60.09 
 
 		 431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  56.9 
 
 		 433 aa  432  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  56.32 
 
 		 442 aa  421  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  54.59 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  55.22 
 
 		 405 aa  410  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1057  major facilitator superfamily MFS_1  61.98 
 
 		 424 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  54.12 
 
 		 424 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  50.38 
 
 		 433 aa  355  7.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  51.62 
 
 		 441 aa  341  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  45.85 
 
 		 428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  44.66 
 
 		 430 aa  329  5.0000000000000004e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  45.1 
 
 		 431 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  47.24 
 
 		 435 aa  319  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03015  putative transport transmembrane protein  45.33 
 
 		 432 aa  316  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.120422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  45.24 
 
 		 431 aa  316  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  45.93 
 
 		 428 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  46.31 
 
 		 427 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  46.12 
 
 		 427 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  46.44 
 
 		 429 aa  309  5e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  43.73 
 
 		 430 aa  308  9e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3966  major facilitator superfamily MFS_1  44.96 
 
 		 432 aa  306  6e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  0.02436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  44.96 
 
 		 432 aa  306  6e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  43.98 
 
 		 429 aa  306  7e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  48.8 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  46.73 
 
 		 425 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3626  major facilitator transporter  46.41 
 
 		 427 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  46.72 
 
 		 418 aa  300  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1737  major facilitator transporter  46.17 
 
 		 427 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2806  transporter, putative  46.17 
 
 		 427 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3171  major facilitator transporter  46.17 
 
 		 427 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0029  major facilitator transporter  46.17 
 
 		 427 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  46.17 
 
 		 427 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3613  monocarboxylate MFS permease  46.27 
 
 		 427 aa  299  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  44.59 
 
 		 457 aa  299  7e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  46.02 
 
 		 427 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  45.78 
 
 		 427 aa  296  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  45.04 
 
 		 427 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  44.36 
 
 		 427 aa  292  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  43.6 
 
 		 435 aa  292  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  47.24 
 
 		 428 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0305  major facilitator superfamily MFS_1  48.75 
 
 		 432 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382232  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2897  major facilitator transporter  45.78 
 
 		 427 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388241  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0473  major facilitator transporter  45.78 
 
 		 427 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.472982 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0500  major facilitator transporter  45.78 
 
 		 427 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2605  major facilitator transporter  45.78 
 
 		 427 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0431  major facilitator transporter  45.54 
 
 		 427 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.592654  normal  0.379231 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0405  major facilitator transporter  45.54 
 
 		 427 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  46.1 
 
 		 409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  45.85 
 
 		 436 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  45.88 
 
 		 422 aa  280  4e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3588  major facilitator transporter  45.06 
 
 		 427 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.94844  normal  0.904194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  41.52 
 
 		 437 aa  259  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 427 aa  252  9.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 406 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  32.3 
 
 		 407 aa  164  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 406 aa  157  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  32.82 
 
 		 412 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  31.26 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 417 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 405 aa  152  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 402 aa  150  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  33.25 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 408 aa  146  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  28.85 
 
 		 452 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 452 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  29.89 
 
 		 430 aa  142  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 436 aa  141  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  29.41 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 425 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 403 aa  137  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  32.25 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 409 aa  132  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 402 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  32.05 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 410 aa  126  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  32.75 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 408 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  30 
 
 		 410 aa  121  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  29.67 
 
 		 528 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  31.63 
 
 		 412 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  28.86 
 
 		 434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>