More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_16310 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
402 aa  765    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  81.7 
 
 
400 aa  617  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  81.06 
 
 
402 aa  598  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  80.3 
 
 
402 aa  595  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  81.45 
 
 
400 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  81.06 
 
 
406 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  85.82 
 
 
399 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  81.27 
 
 
402 aa  578  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  83.8 
 
 
399 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  81.2 
 
 
400 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  81.25 
 
 
401 aa  560  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  62.92 
 
 
408 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  58.44 
 
 
407 aa  418  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  62.76 
 
 
408 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  54.31 
 
 
402 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  56.85 
 
 
417 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  55.04 
 
 
403 aa  408  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  60.88 
 
 
410 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  56.7 
 
 
414 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  53.94 
 
 
425 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  53.15 
 
 
410 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  53.32 
 
 
406 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  53.96 
 
 
412 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  55.04 
 
 
413 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  55.96 
 
 
408 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  54.26 
 
 
405 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  54.26 
 
 
405 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  55.61 
 
 
405 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  48.08 
 
 
406 aa  363  3e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  51.81 
 
 
407 aa  363  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  54.96 
 
 
430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  47.24 
 
 
404 aa  355  7.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  44.47 
 
 
404 aa  352  5.9999999999999994e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  48.48 
 
 
414 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  46.09 
 
 
404 aa  347  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  51.4 
 
 
410 aa  345  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  52.45 
 
 
410 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  51.4 
 
 
410 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  47.34 
 
 
412 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  51.4 
 
 
410 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  47.38 
 
 
436 aa  334  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  51.15 
 
 
410 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  50.13 
 
 
410 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  47.09 
 
 
417 aa  331  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  47.17 
 
 
480 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  50.13 
 
 
410 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  46.91 
 
 
412 aa  322  6e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  50.37 
 
 
405 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  50.62 
 
 
405 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  47.27 
 
 
528 aa  316  6e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  47.01 
 
 
416 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  45.77 
 
 
416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  44.9 
 
 
413 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  48.56 
 
 
398 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  48.56 
 
 
417 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  48.56 
 
 
417 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  48.56 
 
 
417 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  48.56 
 
 
417 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  48.56 
 
 
417 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  48.56 
 
 
417 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  43.96 
 
 
411 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  47.89 
 
 
409 aa  300  4e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  47.51 
 
 
409 aa  298  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  43.7 
 
 
411 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  41.28 
 
 
421 aa  296  5e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  47.52 
 
 
414 aa  295  9e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  42.93 
 
 
411 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  40.84 
 
 
433 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  41.13 
 
 
412 aa  281  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  40.89 
 
 
414 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  39.85 
 
 
412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  39.85 
 
 
412 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  38.82 
 
 
415 aa  260  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  39.34 
 
 
405 aa  256  6e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  38.81 
 
 
411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  41.22 
 
 
415 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  37.34 
 
 
403 aa  235  8e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  40.36 
 
 
412 aa  235  8e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  41.52 
 
 
427 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  37.53 
 
 
411 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  39.1 
 
 
421 aa  210  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  36.22 
 
 
389 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  31.93 
 
 
414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  34.75 
 
 
422 aa  146  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 
442 aa  146  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 
433 aa  144  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  30.05 
 
 
428 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  33.33 
 
 
433 aa  137  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  30.9 
 
 
435 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  31 
 
 
425 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 
437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  30.33 
 
 
436 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 
438 aa  129  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  30.52 
 
 
431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  30.37 
 
 
442 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  29.23 
 
 
429 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  29.43 
 
 
430 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  31.15 
 
 
427 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  30 
 
 
427 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>