More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2770 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  100 
 
 		 414 aa  811    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  74.56 
 
 		 412 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  74.31 
 
 		 412 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  74.63 
 
 		 433 aa  609  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  71.74 
 
 		 412 aa  593  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  68.24 
 
 		 415 aa  550  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  67.82 
 
 		 411 aa  540  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  64 
 
 		 421 aa  526  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  44.96 
 
 		 412 aa  322  6e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  43.67 
 
 		 417 aa  309  5e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  43.89 
 
 		 406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  41.46 
 
 		 414 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 412 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  42.55 
 
 		 407 aa  301  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  43.21 
 
 		 405 aa  296  5e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 414 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  41.2 
 
 		 436 aa  288  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  38.5 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  40.89 
 
 		 402 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  41.19 
 
 		 406 aa  276  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 404 aa  276  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  39.41 
 
 		 403 aa  275  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  36.88 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  39.75 
 
 		 417 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  37.35 
 
 		 411 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  40.25 
 
 		 407 aa  269  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 400 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 411 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 400 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  39.81 
 
 		 405 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  39.81 
 
 		 405 aa  264  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 		 411 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 410 aa  260  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  38.92 
 
 		 412 aa  259  6e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  38.33 
 
 		 413 aa  259  6e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  39.8 
 
 		 406 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 408 aa  259  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  39.13 
 
 		 528 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  41.03 
 
 		 416 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  40 
 
 		 402 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  38.81 
 
 		 430 aa  256  7e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  37.93 
 
 		 413 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  38.42 
 
 		 425 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  40.64 
 
 		 402 aa  253  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  39.35 
 
 		 402 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  38.73 
 
 		 416 aa  249  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 400 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  38.98 
 
 		 417 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  38.98 
 
 		 417 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  38.98 
 
 		 417 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  38.98 
 
 		 417 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  38.98 
 
 		 417 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  38.98 
 
 		 417 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 414 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  38.92 
 
 		 398 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 401 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  37.68 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  38.63 
 
 		 408 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  36.03 
 
 		 410 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  37.68 
 
 		 399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 		 405 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  38.25 
 
 		 480 aa  233  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  39.56 
 
 		 405 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  36 
 
 		 410 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  36.76 
 
 		 410 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 410 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  36.76 
 
 		 410 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  36.76 
 
 		 410 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 405 aa  222  7e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  36.27 
 
 		 410 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 403 aa  204  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 409 aa  203  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  33.92 
 
 		 409 aa  202  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  36.78 
 
 		 411 aa  193  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 415 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  33.59 
 
 		 412 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  33.76 
 
 		 421 aa  167  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  32.25 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  26.41 
 
 		 430 aa  111  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  26.65 
 
 		 429 aa  111  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  27.08 
 
 		 452 aa  106  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 422 aa  106  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3953  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 410 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3403  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  27.09 
 
 		 430 aa  103  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3966  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  0.02436 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 457 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 420 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 427 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 428 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>