211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3953 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3953  major facilitator transporter  100 
 
 		 410 aa  799    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3403  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1997  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.314351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4647  major facilitator superfamily MFS_1  34.18 
 
 		 416 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  30.86 
 
 		 414 aa  123  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 412 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 433 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 400 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 414 aa  119  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 402 aa  114  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  30.52 
 
 		 425 aa  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  26.8 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 417 aa  109  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 406 aa  109  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 408 aa  106  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  26.81 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 404 aa  103  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  30.19 
 
 		 528 aa  103  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 404 aa  101  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 417 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 412 aa  99.8  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 405 aa  99.8  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  27.98 
 
 		 405 aa  99.8  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 415 aa  99.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  27.08 
 
 		 430 aa  99  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  28.33 
 
 		 407 aa  99.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 410 aa  99  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 427 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 427 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  29.92 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 410 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 422 aa  96.3  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  29.27 
 
 		 398 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  25 
 
 		 421 aa  95.5  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  29.27 
 
 		 417 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 403 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  29.27 
 
 		 417 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  29.27 
 
 		 417 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  29.27 
 
 		 417 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  29.27 
 
 		 417 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  29.27 
 
 		 417 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 410 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 402 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 409 aa  94  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 435 aa  94  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 406 aa  94.4  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  27.68 
 
 		 412 aa  94.4  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  27.99 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 442 aa  93.6  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  29.01 
 
 		 399 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  27.12 
 
 		 430 aa  92.8  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 428 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  28.4 
 
 		 435 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 416 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 410 aa  89.7  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  27.4 
 
 		 429 aa  89.7  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 409 aa  89.7  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2806  transporter, putative  28.3 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3613  monocarboxylate MFS permease  28.3 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 409 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3171  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 405 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0029  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1737  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  27.01 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  28.3 
 
 		 421 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3626  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 427 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  24.36 
 
 		 452 aa  87.8  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 425 aa  87.8  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 427 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 438 aa  87  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  28.66 
 
 		 412 aa  86.7  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  28.3 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 		 431 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>