293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1997 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1997  major facilitator transporter  100 
 
 		 433 aa  831    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.314351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4647  major facilitator superfamily MFS_1  47.73 
 
 		 416 aa  326  6e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3953  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 410 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3403  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 		 433 aa  103  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  27.3 
 
 		 528 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  29.97 
 
 		 414 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  27.07 
 
 		 407 aa  98.2  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 438 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 409 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 414 aa  93.2  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  27.85 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 433 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 422 aa  91.3  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 403 aa  90.5  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 411 aa  90.1  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 436 aa  89.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 400 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  25.82 
 
 		 417 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  25.82 
 
 		 417 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  25.82 
 
 		 417 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 417 aa  87.4  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  25.82 
 
 		 417 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  25.82 
 
 		 417 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  25.82 
 
 		 417 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 		 472 aa  87  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 405 aa  86.7  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 442 aa  86.7  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 405 aa  86.7  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  26.67 
 
 		 405 aa  86.7  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  25.18 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  24.51 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  25.52 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  26.24 
 
 		 398 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  28.2 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  27.89 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 400 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  26.42 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  23.06 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  26.32 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  27.11 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  26.87 
 
 		 421 aa  76.3  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  22.02 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 389 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  24.64 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  27.59 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  24.75 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  25.16 
 
 		 430 aa  69.7  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  24.72 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  25.9 
 
 		 452 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>