More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2737 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 405 aa  788    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2451  major facilitator transporter  80.54 
 
 		 417 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.367941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2999  major facilitator transporter  80.39 
 
 		 408 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3959  hypothetical protein  73.67 
 
 		 422 aa  522  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  31.19 
 
 		 434 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 430 aa  110  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 431 aa  106  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 406 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 414 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  27.61 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  29.64 
 
 		 435 aa  101  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  30 
 
 		 405 aa  101  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 405 aa  100  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 422 aa  100  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 400 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 410 aa  99.4  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 		 413 aa  99.8  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 400 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 427 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 410 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 412 aa  97.4  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  28.57 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 459 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 402 aa  94.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 410 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 415 aa  94.4  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  26.45 
 
 		 425 aa  94  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  27.44 
 
 		 414 aa  94.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 427 aa  93.6  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 410 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 410 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 420 aa  93.2  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 404 aa  93.2  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  28.89 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 418 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 410 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 413 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  26.67 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  27.59 
 
 		 423 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 423 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 433 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 402 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 412 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 435 aa  91.3  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 437 aa  90.9  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 412 aa  90.5  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 429 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 432 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 410 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 411 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  24.49 
 
 		 430 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 404 aa  87.4  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 405 aa  87.4  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 430 aa  87  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 430 aa  87  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 402 aa  87  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 411 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  29.47 
 
 		 402 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 427 aa  86.7  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_003296  RS03015  putative transport transmembrane protein  26.44 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.120422 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  28.17 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 409 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  28.61 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 431 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  25 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  28.05 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  25 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 436 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>