196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4647 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4647  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 416 aa  803    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1997  major facilitator transporter  49.49 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.314351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3953  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 410 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3403  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 409 aa  93.6  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  27.2 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 433 aa  90.9  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 414 aa  89.7  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  27 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 410 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  25.2 
 
 		 404 aa  89  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 404 aa  87.8  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 403 aa  87  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  30.21 
 
 		 405 aa  86.7  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 410 aa  86.7  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 405 aa  86.3  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 442 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  22.58 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 431 aa  79.7  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  23.28 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  23.83 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  25.9 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  27.27 
 
 		 528 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  24.23 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  25.13 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  26.49 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  25 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  26.3 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2806  transporter, putative  24.79 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3613  monocarboxylate MFS permease  24.79 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 472 aa  73.6  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  28.53 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0029  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1737  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3171  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3626  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  28.57 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  28.57 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  24.03 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  24.51 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 408 aa  69.7  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  27.27 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  23.22 
 
 		 431 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  27.3 
 
 		 480 aa  67  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03015  putative transport transmembrane protein  23.95 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.120422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  22.41 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  26.8 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  28.57 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1067  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>