More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1093 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  90.24 
 
 
410 aa  672    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  100 
 
 
410 aa  793    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  88.54 
 
 
410 aa  687    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  90.24 
 
 
410 aa  670    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  89.51 
 
 
410 aa  663    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  90.24 
 
 
410 aa  672    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  89.51 
 
 
410 aa  669    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  64.74 
 
 
405 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  65.24 
 
 
405 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  62.11 
 
 
480 aa  425  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  53.47 
 
 
414 aa  404  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  50.39 
 
 
403 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  53.75 
 
 
407 aa  394  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  50.12 
 
 
425 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  52.2 
 
 
406 aa  388  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  51.79 
 
 
417 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  48.88 
 
 
412 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  50.65 
 
 
408 aa  368  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  49.88 
 
 
413 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  48.88 
 
 
405 aa  363  4e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  48.88 
 
 
405 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  47.31 
 
 
410 aa  358  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  50.51 
 
 
407 aa  356  2.9999999999999997e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  48.14 
 
 
402 aa  354  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  52.2 
 
 
430 aa  354  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  53.23 
 
 
402 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  50 
 
 
400 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  48.35 
 
 
405 aa  338  9e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  48.32 
 
 
402 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  50.26 
 
 
408 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  49.21 
 
 
400 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  48.06 
 
 
402 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  52.2 
 
 
399 aa  332  5e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  48.84 
 
 
402 aa  332  8e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  48.69 
 
 
406 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  49.09 
 
 
528 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  41.51 
 
 
404 aa  329  4e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  46.45 
 
 
416 aa  330  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  50.53 
 
 
408 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  41.91 
 
 
404 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  45.36 
 
 
414 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  47.12 
 
 
416 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  49.24 
 
 
401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  49.34 
 
 
400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  51.42 
 
 
399 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  42.97 
 
 
406 aa  325  9e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  40.8 
 
 
404 aa  323  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  43.22 
 
 
412 aa  319  5e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  49.11 
 
 
410 aa  318  9e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  43.55 
 
 
436 aa  318  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  42.71 
 
 
412 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  49.19 
 
 
414 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  47.67 
 
 
409 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  47.73 
 
 
409 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  46.25 
 
 
417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  47.29 
 
 
398 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  46.25 
 
 
417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  46.25 
 
 
417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  46.25 
 
 
417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  46.25 
 
 
417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  46.25 
 
 
417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  43.36 
 
 
417 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  42.75 
 
 
411 aa  302  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  41.52 
 
 
413 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  41.52 
 
 
411 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  42.17 
 
 
411 aa  295  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  40.4 
 
 
433 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  39.9 
 
 
412 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  39.65 
 
 
412 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  38.81 
 
 
421 aa  271  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  39.28 
 
 
405 aa  257  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  37.14 
 
 
415 aa  257  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  36.83 
 
 
412 aa  255  8e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  36.66 
 
 
414 aa  255  9e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  36.63 
 
 
411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  37.11 
 
 
403 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  38.54 
 
 
415 aa  226  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  37.91 
 
 
412 aa  223  6e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  40.53 
 
 
421 aa  218  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  37.56 
 
 
427 aa  207  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  35.88 
 
 
389 aa  196  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  35.29 
 
 
411 aa  190  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  32.99 
 
 
422 aa  145  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 
405 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
433 aa  133  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  30.85 
 
 
414 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  29.68 
 
 
428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 
442 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  28.57 
 
 
442 aa  123  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 
430 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 
438 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 
431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 
409 aa  116  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 
472 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  27.68 
 
 
430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  30.14 
 
 
427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  26.92 
 
 
430 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  27.27 
 
 
429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  28.39 
 
 
431 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>