262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0111 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  100 
 
 		 411 aa  802    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  69.7 
 
 		 412 aa  585  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  67.79 
 
 		 415 aa  564  1e-160  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  67.81 
 
 		 433 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  68.08 
 
 		 412 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  67.83 
 
 		 412 aa  554  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  67.82 
 
 		 414 aa  553  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  65.09 
 
 		 421 aa  525  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  42.4 
 
 		 417 aa  309  5e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  42.25 
 
 		 412 aa  293  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 406 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  41.35 
 
 		 414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  41.03 
 
 		 412 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  38.85 
 
 		 407 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  39.31 
 
 		 402 aa  273  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  39.25 
 
 		 414 aa  270  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  37.15 
 
 		 404 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  40.15 
 
 		 406 aa  263  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  37.38 
 
 		 405 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 436 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 410 aa  259  7e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  38.06 
 
 		 400 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 408 aa  257  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  38.56 
 
 		 402 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 425 aa  256  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  38.31 
 
 		 400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  39.55 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  40.5 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 417 aa  252  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  36.39 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  37.81 
 
 		 406 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 407 aa  249  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  37.38 
 
 		 413 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  39.11 
 
 		 402 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 404 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  39.01 
 
 		 416 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  38.81 
 
 		 402 aa  246  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  36.59 
 
 		 412 aa  246  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  37.59 
 
 		 405 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 400 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  37.59 
 
 		 405 aa  244  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  38.15 
 
 		 528 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  35 
 
 		 411 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  38.4 
 
 		 416 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  39.7 
 
 		 401 aa  237  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 411 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  38.88 
 
 		 408 aa  236  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  39.4 
 
 		 408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  38.05 
 
 		 480 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 413 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  36.5 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  39.15 
 
 		 398 aa  229  7e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  39.15 
 
 		 417 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  39.15 
 
 		 417 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  39.15 
 
 		 417 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  39.15 
 
 		 417 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  39.15 
 
 		 417 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  39.15 
 
 		 417 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  37.31 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  39.14 
 
 		 405 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 410 aa  226  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  38.71 
 
 		 405 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 410 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 410 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 410 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 410 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  37.74 
 
 		 414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  37.81 
 
 		 410 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  34.72 
 
 		 409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 		 409 aa  195  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 411 aa  176  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  31.57 
 
 		 421 aa  169  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  33.5 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 		 442 aa  109  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  27.55 
 
 		 452 aa  106  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  26.4 
 
 		 429 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  26.4 
 
 		 430 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 		 452 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 433 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 431 aa  99.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 431 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 457 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  27.82 
 
 		 425 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  27.37 
 
 		 430 aa  97.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 405 aa  97.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 438 aa  92.8  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>