More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1067 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1067  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 417 aa  817    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  74.49 
 
 		 394 aa  568  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  63.66 
 
 		 409 aa  461  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  62.32 
 
 		 414 aa  455  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  50.6 
 
 		 417 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.969548 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  56.69 
 
 		 411 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  53.02 
 
 		 416 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6515  major facilitator superfamily permease  53.06 
 
 		 412 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3665  major facilitator transporter  52.76 
 
 		 415 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6050  major facilitator superfamily MFS_1  51.72 
 
 		 419 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0943  major facilitator transporter  52.39 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1829  major facilitator superfamily MFS_1  53.52 
 
 		 414 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  51.52 
 
 		 411 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 400 aa  140  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 413 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  32.01 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 430 aa  124  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  29.14 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 409 aa  99.8  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 405 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 408 aa  96.7  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 420 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 411 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 406 aa  93.6  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 411 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 411 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 424 aa  92.8  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  27.82 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 459 aa  90.5  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 422 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 418 aa  88.2  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  25.93 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36120  monocarboxylate permease homologue  24.7 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.590226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  27.68 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 427 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  24.48 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  24.12 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  24.39 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 457 aa  79.7  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 427 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4647  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  25.28 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  23.85 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 421 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  24.27 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  23.33 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  32.17 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08789  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12710)  26.2 
 
 		 506 aa  73.2  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  23.59 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  23.59 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  23.59 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  23.84 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  23.33 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  25.31 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  23.33 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  25 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  24.28 
 
 		 421 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  23.33 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  23.48 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  25.14 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  23.33 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  22.56 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  23.08 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  26.13 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>