More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7884 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 411 aa  797    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  62.53 
 
 		 411 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6515  major facilitator superfamily permease  61.31 
 
 		 412 aa  472  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3665  major facilitator transporter  63.04 
 
 		 415 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  62.03 
 
 		 416 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1829  major facilitator superfamily MFS_1  65.1 
 
 		 414 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  55.39 
 
 		 409 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  55.53 
 
 		 414 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  52.33 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0943  major facilitator transporter  51.14 
 
 		 407 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  49.25 
 
 		 417 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.969548 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6050  major facilitator superfamily MFS_1  50.38 
 
 		 419 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1067  major facilitator superfamily MFS_1  50.86 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 404 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 		 413 aa  107  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 404 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  26.46 
 
 		 410 aa  103  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 405 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 411 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 411 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 411 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 409 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 410 aa  93.2  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 420 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02746  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05170)  26.08 
 
 		 436 aa  87.8  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10624  normal  0.606528 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  28.5 
 
 		 423 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 423 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 459 aa  86.7  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 424 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  25.4 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02358  conserved hypothetical protein  28.43 
 
 		 448 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  25.93 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08789  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12710)  25.4 
 
 		 506 aa  70.1  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2885  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  23.63 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  23.31 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37914  monocarboxylate permease  22.9 
 
 		 421 aa  67  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  26.78 
 
 		 429 aa  67  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 418 aa  66.2  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 422 aa  66.2  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30034  monocarboxylate permease homolog  21.7 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4386  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2394  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000021703  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04098  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12790)  26.76 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.180766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  25.7 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4678  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02840  Monocarboxylate transporter-like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874I2]  26.43 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00450414 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  29.31 
 
 		 433 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  22.01 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11680  sugar phosphate permease  21.65 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.47668  normal  0.233511 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  26.95 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10410  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05660)  25.35 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06429  conserved hypothetical protein  27.3 
 
 		 450 aa  59.7  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000314614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36120  monocarboxylate permease homologue  23.51 
 
 		 439 aa  59.7  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.590226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  22.65 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  22.66 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 430 aa  57  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 460 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 448 aa  57  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.418078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>