More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2637 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 455 aa  902    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  62.95 
 
 		 454 aa  571  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  62.02 
 
 		 458 aa  555  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  61.56 
 
 		 439 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  61.56 
 
 		 439 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  59.11 
 
 		 456 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  56.04 
 
 		 454 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  59.77 
 
 		 452 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6046  major facilitator transporter  60.51 
 
 		 446 aa  504  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  59.77 
 
 		 452 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  57.31 
 
 		 450 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  58.74 
 
 		 455 aa  492  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  57.08 
 
 		 450 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  58.37 
 
 		 456 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1618  major facilitator transporter  57.52 
 
 		 458 aa  463  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1099  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  55.28 
 
 		 461 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  54.79 
 
 		 448 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  51.04 
 
 		 456 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  45.88 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  49.1 
 
 		 443 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  47.19 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  44.82 
 
 		 446 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  46.4 
 
 		 445 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  46.14 
 
 		 442 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  46.14 
 
 		 442 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  46.14 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  41.55 
 
 		 451 aa  323  3e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  45.31 
 
 		 440 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 		 446 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 		 450 aa  302  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  35.1 
 
 		 452 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  40.1 
 
 		 446 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  39.62 
 
 		 446 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 443 aa  285  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  34.32 
 
 		 435 aa  277  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  38.14 
 
 		 433 aa  269  7e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  37.59 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  37.59 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  37.59 
 
 		 433 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  38.14 
 
 		 433 aa  266  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  37.35 
 
 		 433 aa  266  7e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  37.9 
 
 		 433 aa  263  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  37.16 
 
 		 433 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  36.92 
 
 		 433 aa  262  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 436 aa  249  9e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  35.85 
 
 		 433 aa  236  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 442 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  33.72 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  34.16 
 
 		 453 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  34.16 
 
 		 453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  34.16 
 
 		 453 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 465 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 437 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 444 aa  213  7.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 450 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  34.06 
 
 		 461 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 453 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 449 aa  210  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 428 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  34.33 
 
 		 451 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  34.33 
 
 		 451 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 453 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  31.55 
 
 		 475 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  34.33 
 
 		 451 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  34.33 
 
 		 451 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  34.33 
 
 		 451 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  34.33 
 
 		 451 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  34.33 
 
 		 451 aa  206  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  31.04 
 
 		 441 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 453 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 453 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  34.54 
 
 		 448 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  33.33 
 
 		 448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  33.11 
 
 		 448 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  31.82 
 
 		 465 aa  199  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 449 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2580  major facilitator transporter  34.16 
 
 		 467 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2604  major facilitator transporter  34.16 
 
 		 467 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.792684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1969  major facilitator transporter  34.16 
 
 		 467 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364305  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0717  major facilitator transporter  34 
 
 		 530 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320017 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  33.66 
 
 		 579 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 447 aa  196  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2628  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 465 aa  196  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2499  major facilitator transporter  34 
 
 		 465 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4045  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5911  major facilitator transporter  32.83 
 
 		 487 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  33.49 
 
 		 448 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  31.41 
 
 		 455 aa  194  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 449 aa  193  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 447 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3852  major facilitator superfamily MFS_1  37.77 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000421805  normal  0.905597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 457 aa  192  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 459 aa  191  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4011  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 435 aa  190  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.46849  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  31.15 
 
 		 445 aa  189  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  31 
 
 		 449 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>