More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0647 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
451 aa  895    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  58.16 
 
 
446 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  64.32 
 
 
443 aa  508  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  62.68 
 
 
442 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  55.91 
 
 
454 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  61.36 
 
 
442 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  60.91 
 
 
442 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  59.44 
 
 
454 aa  491  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  60.45 
 
 
440 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  60.73 
 
 
445 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  54.38 
 
 
458 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  55.07 
 
 
439 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  55.07 
 
 
439 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  56.07 
 
 
455 aa  460  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  51.95 
 
 
454 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  54.32 
 
 
448 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  56.31 
 
 
456 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  55.42 
 
 
443 aa  420  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1618  major facilitator transporter  52.44 
 
 
458 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1099  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  48.18 
 
 
461 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863734  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  48.13 
 
 
456 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  44.89 
 
 
450 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  44.89 
 
 
450 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  47.4 
 
 
446 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  47.17 
 
 
446 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  48.01 
 
 
446 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  46.73 
 
 
451 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  44.03 
 
 
452 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  46.4 
 
 
456 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6046  major facilitator transporter  46.96 
 
 
446 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  43.68 
 
 
452 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  47.19 
 
 
455 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  41.44 
 
 
450 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  40.59 
 
 
452 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  41.08 
 
 
442 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  39.76 
 
 
433 aa  291  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  39.25 
 
 
433 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  40.89 
 
 
436 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  39.76 
 
 
433 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  39.39 
 
 
433 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  39.53 
 
 
433 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  39.91 
 
 
437 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  40.39 
 
 
436 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  39.39 
 
 
433 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  39.39 
 
 
433 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  40.24 
 
 
428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  35.35 
 
 
435 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  36.91 
 
 
454 aa  269  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  36.49 
 
 
455 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  38.12 
 
 
436 aa  264  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  35.45 
 
 
475 aa  257  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  40.35 
 
 
433 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  34.83 
 
 
452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  35.78 
 
 
453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  34.83 
 
 
452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  36.08 
 
 
453 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  34.61 
 
 
453 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 
451 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  36.28 
 
 
457 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4011  major facilitator transporter  38.97 
 
 
435 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.46849  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  35.94 
 
 
453 aa  242  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  34.24 
 
 
450 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  33.26 
 
 
441 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  34.16 
 
 
453 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  34.62 
 
 
459 aa  236  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  34.55 
 
 
468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  35.03 
 
 
465 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 
444 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  32.66 
 
 
449 aa  229  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3425  major facilitator superfamily MFS_1  34.61 
 
 
436 aa  229  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  34.68 
 
 
453 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  33.8 
 
 
451 aa  229  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  33.81 
 
 
451 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  31.65 
 
 
448 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  33.81 
 
 
451 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  31.55 
 
 
438 aa  229  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  33.81 
 
 
451 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  33.81 
 
 
451 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  33.81 
 
 
451 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  34.84 
 
 
453 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  33.81 
 
 
451 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  32.31 
 
 
449 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  35.65 
 
 
451 aa  227  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  33.81 
 
 
451 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  33.78 
 
 
454 aa  226  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  31.8 
 
 
448 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  33.33 
 
 
456 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  35.48 
 
 
449 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 
451 aa  223  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  32.84 
 
 
448 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  37.53 
 
 
441 aa  223  7e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  35.06 
 
 
453 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  35.06 
 
 
453 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  34.25 
 
 
447 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  31.35 
 
 
452 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  35.01 
 
 
452 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  36.32 
 
 
449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  34.43 
 
 
452 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  35.02 
 
 
445 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  34.27 
 
 
452 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>