More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6046 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6046  major facilitator transporter  100 
 
 		 446 aa  896    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  65.32 
 
 		 454 aa  585  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  61.99 
 
 		 458 aa  553  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  60.46 
 
 		 439 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  60.18 
 
 		 452 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  60.46 
 
 		 439 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  59.51 
 
 		 452 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  57.81 
 
 		 450 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  58.17 
 
 		 454 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  57.59 
 
 		 450 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  60.05 
 
 		 456 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  57.94 
 
 		 455 aa  503  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  59.73 
 
 		 455 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  59.77 
 
 		 456 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  58.51 
 
 		 448 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1099  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  54.16 
 
 		 461 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1618  major facilitator transporter  55.96 
 
 		 458 aa  448  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  52.83 
 
 		 456 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  46.03 
 
 		 454 aa  403  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  49.66 
 
 		 443 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  45.91 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  45.64 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  46.5 
 
 		 442 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  46.5 
 
 		 442 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  46.05 
 
 		 442 aa  358  8e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  46.28 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  44.14 
 
 		 445 aa  348  8e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 451 aa  333  4e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  37.59 
 
 		 452 aa  317  4e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  40.69 
 
 		 446 aa  316  6e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  42.44 
 
 		 443 aa  315  7e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  39.29 
 
 		 446 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 		 450 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  37.64 
 
 		 446 aa  299  9e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 		 435 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  35.29 
 
 		 433 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  35.29 
 
 		 433 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 433 aa  253  6e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  35.54 
 
 		 433 aa  252  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  35 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  36.24 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  35 
 
 		 433 aa  250  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  35.92 
 
 		 433 aa  250  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  36 
 
 		 436 aa  249  6e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  35 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 453 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 442 aa  227  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 453 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 453 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 452 aa  226  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 452 aa  226  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.99 
 
 		 461 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 449 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 428 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  33.11 
 
 		 465 aa  216  8e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  31.19 
 
 		 454 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  34.15 
 
 		 450 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  32.49 
 
 		 448 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 		 447 aa  211  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  34.49 
 
 		 453 aa  210  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  32.49 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  31.21 
 
 		 455 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  32.24 
 
 		 448 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  29.87 
 
 		 452 aa  206  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  32.49 
 
 		 448 aa  206  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  34.08 
 
 		 452 aa  206  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 437 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 		 444 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 438 aa  205  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 452 aa  205  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 465 aa  203  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  31.84 
 
 		 451 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  31.84 
 
 		 451 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  31.84 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  31.84 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  31.84 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  31.84 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  29.35 
 
 		 475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  29.55 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 		 448 aa  201  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4045  major facilitator transporter  36.87 
 
 		 421 aa  201  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 454 aa  201  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 454 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  31.84 
 
 		 451 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 453 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  30.07 
 
 		 451 aa  199  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3852  major facilitator superfamily MFS_1  39.32 
 
 		 446 aa  199  9e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000421805  normal  0.905597 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.48 
 
 		 465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20360  major facilitator superfamily (MFS) permease  32.27 
 
 		 432 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  31.14 
 
 		 445 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 		 433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0937  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 448 aa  196  7e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.699917  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  34.13 
 
 		 454 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 452 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  32 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4011  protocatechuate (4-hydroxybenzoate) transmembrane transporter  31.7 
 
 		 459 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  32 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  31.31 
 
 		 448 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 457 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 449 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>