More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3199 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  100 
 
 		 449 aa  876    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  74.25 
 
 		 446 aa  579  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  56.49 
 
 		 449 aa  481  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  55.15 
 
 		 441 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  59.35 
 
 		 449 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  59.12 
 
 		 450 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  55.35 
 
 		 459 aa  438  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  50.69 
 
 		 451 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  52.53 
 
 		 452 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  51.26 
 
 		 458 aa  388  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  48.97 
 
 		 448 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  48.97 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  50.34 
 
 		 448 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  45.45 
 
 		 454 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  52.52 
 
 		 449 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  47.98 
 
 		 454 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  50.72 
 
 		 448 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  52.91 
 
 		 448 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  47.66 
 
 		 465 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  49.1 
 
 		 447 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  44.29 
 
 		 447 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  49.89 
 
 		 447 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  49.66 
 
 		 453 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  52.32 
 
 		 448 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4011  protocatechuate (4-hydroxybenzoate) transmembrane transporter  50.72 
 
 		 459 aa  365  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  46.39 
 
 		 452 aa  363  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  44.99 
 
 		 448 aa  363  3e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  47.22 
 
 		 452 aa  360  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1205  4-hydroxybenzoate transporter  52.98 
 
 		 451 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0050  4-hydroxybenzoate transporter  52.98 
 
 		 451 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1488  4-hydroxybenzoate transporter  52.98 
 
 		 451 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0061  4-hydroxybenzoate transporter  52.98 
 
 		 451 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586422  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  43.75 
 
 		 452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  47.22 
 
 		 452 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  47.95 
 
 		 461 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  47.42 
 
 		 449 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  44.24 
 
 		 449 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2124  benzoate transport  52.27 
 
 		 449 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798093  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  49.31 
 
 		 453 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  49.31 
 
 		 453 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  48.04 
 
 		 453 aa  349  6e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1558  4-hydroxybenzoate transporter  52.75 
 
 		 451 aa  349  7e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0059  4-hydroxybenzoate transporter  52.75 
 
 		 451 aa  349  7e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0072  4-hydroxybenzoate transporter  52.75 
 
 		 451 aa  348  9e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279221  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  46.79 
 
 		 457 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  45.45 
 
 		 452 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  45.33 
 
 		 458 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  45.2 
 
 		 452 aa  338  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  44.85 
 
 		 455 aa  338  9e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  45.06 
 
 		 451 aa  338  9e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  43.78 
 
 		 465 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  43.54 
 
 		 452 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  47.21 
 
 		 453 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20360  major facilitator superfamily (MFS) permease  46.44 
 
 		 432 aa  335  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4450  major facilitator transporter  45.16 
 
 		 460 aa  334  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489654  normal  0.0331479 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  45.56 
 
 		 456 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  42.4 
 
 		 452 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  45.22 
 
 		 468 aa  332  6e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  43.08 
 
 		 452 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  50.12 
 
 		 449 aa  332  8e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 452 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 452 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  43.33 
 
 		 452 aa  330  4e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  43.33 
 
 		 452 aa  329  7e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  44.73 
 
 		 454 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32660  MFS family transporter  50.34 
 
 		 448 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00466329  hitchhiker  0.0000329882 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  44.29 
 
 		 452 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  44.29 
 
 		 452 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  44.29 
 
 		 452 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  44.29 
 
 		 452 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  47.55 
 
 		 451 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2526  4-hydroxybenzoate transporter  44.29 
 
 		 452 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8635  major facilitator superfamily MFS_1  49.23 
 
 		 458 aa  299  9e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0703703  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  41 
 
 		 458 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 458 aa  296  7e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0807  major facilitator transporter  42.38 
 
 		 386 aa  292  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  40.9 
 
 		 452 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3941  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 449 aa  282  8.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.939508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  38.88 
 
 		 475 aa  277  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  39.12 
 
 		 465 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 453 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  37.61 
 
 		 453 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4567  4-hydroxybenzoate transporter  40.84 
 
 		 458 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0165748  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 452 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 452 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  37.61 
 
 		 453 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 453 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  41.88 
 
 		 441 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 450 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 438 aa  258  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6623  major facilitator transporter  36.1 
 
 		 467 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6390  major facilitator transporter  36.1 
 
 		 467 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.536228  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  37.24 
 
 		 451 aa  256  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  37.24 
 
 		 451 aa  256  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  37.24 
 
 		 451 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  37.24 
 
 		 451 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  37.24 
 
 		 451 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  37.24 
 
 		 451 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>