More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1821 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  80.8 
 
 
447 aa  721    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
448 aa  890    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  65.38 
 
 
452 aa  577  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  54.16 
 
 
461 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  53.36 
 
 
449 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20360  major facilitator superfamily (MFS) permease  55.83 
 
 
432 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  49.65 
 
 
465 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  46.03 
 
 
465 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  45.58 
 
 
448 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  45.39 
 
 
451 aa  381  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  45.58 
 
 
448 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  44.34 
 
 
441 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  45.92 
 
 
448 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  43.95 
 
 
449 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  46.21 
 
 
448 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  46.8 
 
 
457 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  45.48 
 
 
447 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  42.38 
 
 
452 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  46.85 
 
 
458 aa  360  3e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  43.25 
 
 
451 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  47.55 
 
 
448 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  43.6 
 
 
449 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  47.55 
 
 
448 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  45.33 
 
 
452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  46.36 
 
 
449 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  45.68 
 
 
452 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  45.68 
 
 
452 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  43.44 
 
 
452 aa  351  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  43.6 
 
 
452 aa  348  8e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  42.03 
 
 
454 aa  348  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  45.29 
 
 
446 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  43.15 
 
 
452 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  43.15 
 
 
452 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  43.15 
 
 
452 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  43.42 
 
 
452 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  41.61 
 
 
452 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  41.39 
 
 
454 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  43.75 
 
 
453 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  44.42 
 
 
450 aa  341  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  39.41 
 
 
449 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  42.86 
 
 
447 aa  339  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  44.72 
 
 
456 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  42.51 
 
 
453 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  44.86 
 
 
449 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  44.16 
 
 
451 aa  331  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4011  protocatechuate (4-hydroxybenzoate) transmembrane transporter  44.39 
 
 
459 aa  325  8.000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  41.01 
 
 
458 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  44.08 
 
 
459 aa  324  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2124  benzoate transport  45.87 
 
 
449 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798093  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  43.62 
 
 
454 aa  322  8e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  42.46 
 
 
453 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  42.46 
 
 
453 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  42.4 
 
 
453 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  42.86 
 
 
455 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4450  major facilitator transporter  43.67 
 
 
460 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489654  normal  0.0331479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  43.09 
 
 
457 aa  316  6e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  40.95 
 
 
458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0061  4-hydroxybenzoate transporter  45.09 
 
 
451 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586422  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1205  4-hydroxybenzoate transporter  45.09 
 
 
451 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0050  4-hydroxybenzoate transporter  45.09 
 
 
451 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1488  4-hydroxybenzoate transporter  45.09 
 
 
451 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  39.24 
 
 
452 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  39.01 
 
 
452 aa  306  6e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  39.86 
 
 
468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0072  4-hydroxybenzoate transporter  44.63 
 
 
451 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279221  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  42.15 
 
 
449 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0059  4-hydroxybenzoate transporter  44.76 
 
 
451 aa  299  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1558  4-hydroxybenzoate transporter  44.76 
 
 
451 aa  299  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  40.32 
 
 
453 aa  299  8e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  39.48 
 
 
452 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  39.48 
 
 
452 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  39.48 
 
 
452 aa  295  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  39.48 
 
 
452 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0807  major facilitator transporter  40.89 
 
 
386 aa  292  7e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32660  MFS family transporter  40.63 
 
 
448 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00466329  hitchhiker  0.0000329882 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2526  4-hydroxybenzoate transporter  39.72 
 
 
452 aa  283  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  38.5 
 
 
452 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  39.64 
 
 
458 aa  276  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  35.96 
 
 
438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8635  major facilitator superfamily MFS_1  41.15 
 
 
458 aa  272  9e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0703703  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  36.21 
 
 
453 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  36.21 
 
 
453 aa  266  8e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  35.58 
 
 
453 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  33.79 
 
 
475 aa  262  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  34.76 
 
 
452 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  34.76 
 
 
452 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  34.6 
 
 
450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  35.05 
 
 
453 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3941  major facilitator transporter  36.3 
 
 
449 aa  249  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.939508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  38.1 
 
 
441 aa  246  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4567  4-hydroxybenzoate transporter  36.29 
 
 
458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0165748  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  35.97 
 
 
454 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  34.66 
 
 
451 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  34.66 
 
 
451 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  34.66 
 
 
451 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  34.66 
 
 
451 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  34.66 
 
 
451 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  34.66 
 
 
451 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  32.88 
 
 
455 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  34.66 
 
 
451 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>