More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2745 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  90.36 
 
 
461 aa  733    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  100 
 
 
449 aa  880    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  53.94 
 
 
452 aa  458  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  54.4 
 
 
465 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20360  major facilitator superfamily (MFS) permease  61.14 
 
 
432 aa  449  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  53.36 
 
 
448 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  51.57 
 
 
447 aa  442  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  51.38 
 
 
448 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  51.15 
 
 
448 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  52.67 
 
 
458 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  50.58 
 
 
465 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  48.64 
 
 
451 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  49.54 
 
 
448 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  51.39 
 
 
447 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  51.08 
 
 
448 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  50.23 
 
 
457 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  48.52 
 
 
452 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  51.82 
 
 
448 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  44.69 
 
 
449 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  51.82 
 
 
448 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  47.13 
 
 
454 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  51.15 
 
 
449 aa  364  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  46.89 
 
 
452 aa  360  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  45.39 
 
 
452 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  45.58 
 
 
454 aa  360  4e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  45.6 
 
 
441 aa  360  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  46.54 
 
 
452 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  49.32 
 
 
446 aa  353  2.9999999999999997e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  46.56 
 
 
452 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  47.16 
 
 
452 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  46.56 
 
 
452 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  47.16 
 
 
452 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  49.44 
 
 
453 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  46.56 
 
 
452 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  44 
 
 
452 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  43.58 
 
 
449 aa  348  8e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  47.11 
 
 
449 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4011  protocatechuate (4-hydroxybenzoate) transmembrane transporter  49.76 
 
 
459 aa  348  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  48.85 
 
 
453 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  45.09 
 
 
452 aa  345  8e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  41.87 
 
 
458 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  48.28 
 
 
458 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  51.17 
 
 
449 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  45.07 
 
 
452 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  44.84 
 
 
452 aa  341  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2124  benzoate transport  51.73 
 
 
449 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798093  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  45.14 
 
 
451 aa  341  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  49.07 
 
 
453 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  49.2 
 
 
453 aa  339  5e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  49.07 
 
 
453 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  45.5 
 
 
447 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  48.38 
 
 
449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  46.65 
 
 
450 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  45.37 
 
 
452 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  45.37 
 
 
452 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  47.82 
 
 
456 aa  330  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  45.37 
 
 
452 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  44.57 
 
 
453 aa  330  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  45.37 
 
 
452 aa  329  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0061  4-hydroxybenzoate transporter  48.08 
 
 
451 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586422  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32660  MFS family transporter  49.55 
 
 
448 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00466329  hitchhiker  0.0000329882 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0050  4-hydroxybenzoate transporter  48.08 
 
 
451 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1488  4-hydroxybenzoate transporter  48.08 
 
 
451 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1205  4-hydroxybenzoate transporter  48.08 
 
 
451 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  46.22 
 
 
455 aa  323  5e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  44.39 
 
 
468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0072  4-hydroxybenzoate transporter  48.53 
 
 
451 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279221  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2526  4-hydroxybenzoate transporter  45.6 
 
 
452 aa  320  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4450  major facilitator transporter  46.21 
 
 
460 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489654  normal  0.0331479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  44.91 
 
 
451 aa  317  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0059  4-hydroxybenzoate transporter  48.31 
 
 
451 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1558  4-hydroxybenzoate transporter  48.31 
 
 
451 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  46.91 
 
 
454 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  45.45 
 
 
459 aa  314  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  43.82 
 
 
457 aa  314  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0807  major facilitator transporter  43.72 
 
 
386 aa  297  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  43.78 
 
 
458 aa  294  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8635  major facilitator superfamily MFS_1  47.23 
 
 
458 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0703703  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  41.28 
 
 
453 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  37.44 
 
 
452 aa  286  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  41.06 
 
 
452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  41.06 
 
 
452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  39.81 
 
 
453 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  40.46 
 
 
453 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  40.6 
 
 
453 aa  277  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  39.12 
 
 
450 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4567  4-hydroxybenzoate transporter  41.54 
 
 
458 aa  273  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0165748  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3941  major facilitator transporter  40.47 
 
 
449 aa  266  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.939508 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  38.98 
 
 
451 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  38.98 
 
 
451 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  36.19 
 
 
475 aa  259  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  38.98 
 
 
451 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  38.98 
 
 
451 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  38.98 
 
 
451 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  38.98 
 
 
451 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  39.08 
 
 
454 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  38.98 
 
 
451 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  32.72 
 
 
438 aa  256  8e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  42.57 
 
 
441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  39.01 
 
 
454 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>