More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2603 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  100 
 
 		 461 aa  890    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  90.36 
 
 		 449 aa  730    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  54.11 
 
 		 452 aa  458  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  54.16 
 
 		 448 aa  449  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  54.92 
 
 		 465 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20360  major facilitator superfamily (MFS) permease  60.41 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  51.7 
 
 		 447 aa  438  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  53.6 
 
 		 458 aa  408  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  50.92 
 
 		 448 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  50.93 
 
 		 448 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 465 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  51.16 
 
 		 447 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  50 
 
 		 448 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  51.09 
 
 		 448 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  48.15 
 
 		 451 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  51.82 
 
 		 448 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  51.82 
 
 		 448 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  46.44 
 
 		 454 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  48.21 
 
 		 452 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  45.85 
 
 		 449 aa  365  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  49.2 
 
 		 457 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  50.84 
 
 		 449 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  44.69 
 
 		 454 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  44.7 
 
 		 452 aa  356  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  44.16 
 
 		 441 aa  355  8.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  46.44 
 
 		 452 aa  355  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 452 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 452 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  46.56 
 
 		 452 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 452 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  46.56 
 
 		 452 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  52.1 
 
 		 449 aa  349  5e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 458 aa  349  7e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  44.98 
 
 		 452 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  48.97 
 
 		 446 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  45.06 
 
 		 452 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  47.07 
 
 		 449 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  44.84 
 
 		 452 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4011  protocatechuate (4-hydroxybenzoate) transmembrane transporter  49.28 
 
 		 459 aa  342  8e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  45.27 
 
 		 452 aa  340  4e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  46.82 
 
 		 458 aa  339  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 449 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2124  benzoate transport  51.56 
 
 		 449 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798093  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  47.23 
 
 		 453 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  45.05 
 
 		 452 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  48.84 
 
 		 453 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  48.63 
 
 		 449 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  48.71 
 
 		 453 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  48.71 
 
 		 453 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  46.57 
 
 		 456 aa  332  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  45.77 
 
 		 450 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32660  MFS family transporter  50.57 
 
 		 448 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00466329  hitchhiker  0.0000329882 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  47.2 
 
 		 459 aa  326  5e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  48.05 
 
 		 453 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  46.89 
 
 		 455 aa  323  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  45.88 
 
 		 447 aa  322  7e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  44.82 
 
 		 452 aa  322  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  44.82 
 
 		 452 aa  322  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  44.82 
 
 		 452 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  44.82 
 
 		 452 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  42.73 
 
 		 451 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 468 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0061  4-hydroxybenzoate transporter  48.88 
 
 		 451 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586422  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1205  4-hydroxybenzoate transporter  48.88 
 
 		 451 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0050  4-hydroxybenzoate transporter  48.88 
 
 		 451 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1488  4-hydroxybenzoate transporter  48.88 
 
 		 451 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4450  major facilitator transporter  45.05 
 
 		 460 aa  313  4.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489654  normal  0.0331479 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0072  4-hydroxybenzoate transporter  49.1 
 
 		 451 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279221  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2526  4-hydroxybenzoate transporter  44.59 
 
 		 452 aa  310  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  43.31 
 
 		 453 aa  309  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0059  4-hydroxybenzoate transporter  48.88 
 
 		 451 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1558  4-hydroxybenzoate transporter  48.88 
 
 		 451 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0807  major facilitator transporter  45.29 
 
 		 386 aa  306  5.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  45.77 
 
 		 454 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  44.11 
 
 		 457 aa  303  6.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8635  major facilitator superfamily MFS_1  47.73 
 
 		 458 aa  292  9e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0703703  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 451 aa  292  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  39.68 
 
 		 453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  40.51 
 
 		 453 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 453 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  37.5 
 
 		 452 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 452 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 452 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  43.51 
 
 		 458 aa  279  6e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 453 aa  277  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  38.98 
 
 		 450 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3941  major facilitator transporter  40.87 
 
 		 449 aa  266  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.939508 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  38.81 
 
 		 451 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  38.81 
 
 		 451 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  38.81 
 
 		 451 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  38.81 
 
 		 451 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  38.81 
 
 		 451 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  38.81 
 
 		 451 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  38.81 
 
 		 451 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4567  4-hydroxybenzoate transporter  40 
 
 		 458 aa  257  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0165748  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  42.08 
 
 		 441 aa  257  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  35.65 
 
 		 475 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  37.67 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 		 454 aa  252  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  38.13 
 
 		 579 aa  250  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>