More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6105 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  100 
 
 
465 aa  923    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  50.8 
 
 
448 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  50.8 
 
 
448 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  50.58 
 
 
448 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  46.61 
 
 
452 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  51.25 
 
 
448 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  50.81 
 
 
447 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  45.94 
 
 
448 aa  395  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  44.87 
 
 
449 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  50.12 
 
 
461 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  45.24 
 
 
447 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  50.72 
 
 
448 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  48.86 
 
 
454 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  47.33 
 
 
451 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  50.96 
 
 
448 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  50.12 
 
 
449 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  49.31 
 
 
452 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  48.97 
 
 
457 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  48.98 
 
 
458 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  48.43 
 
 
449 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  45.03 
 
 
449 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  45.9 
 
 
449 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  44.26 
 
 
452 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  43.44 
 
 
465 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  42.13 
 
 
441 aa  362  8e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  47.66 
 
 
446 aa  358  8e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  45.01 
 
 
452 aa  358  8e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  43.92 
 
 
452 aa  358  8e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  48.62 
 
 
449 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  46.88 
 
 
453 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  45.16 
 
 
454 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  45.02 
 
 
447 aa  352  8e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  43.95 
 
 
450 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  43.15 
 
 
451 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2124  benzoate transport  49.76 
 
 
449 aa  346  5e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798093  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  41.63 
 
 
458 aa  342  7e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  46.31 
 
 
456 aa  342  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  43.9 
 
 
452 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  46.19 
 
 
458 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  51.03 
 
 
449 aa  339  5e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  43.66 
 
 
452 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0061  4-hydroxybenzoate transporter  48.42 
 
 
451 aa  339  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586422  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1205  4-hydroxybenzoate transporter  48.42 
 
 
451 aa  339  7e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0050  4-hydroxybenzoate transporter  48.42 
 
 
451 aa  339  7e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20360  major facilitator superfamily (MFS) permease  45.89 
 
 
432 aa  339  7e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1488  4-hydroxybenzoate transporter  48.42 
 
 
451 aa  339  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4011  protocatechuate (4-hydroxybenzoate) transmembrane transporter  47.29 
 
 
459 aa  338  9e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  43.85 
 
 
457 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  42.41 
 
 
452 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  42.33 
 
 
452 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  42.33 
 
 
452 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  43.33 
 
 
452 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  42.33 
 
 
452 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0059  4-hydroxybenzoate transporter  48.87 
 
 
451 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1558  4-hydroxybenzoate transporter  48.87 
 
 
451 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0072  4-hydroxybenzoate transporter  48.42 
 
 
451 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279221  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  44.24 
 
 
455 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4450  major facilitator transporter  43.74 
 
 
460 aa  326  5e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489654  normal  0.0331479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  44.24 
 
 
454 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  42.11 
 
 
459 aa  320  3e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  43.98 
 
 
451 aa  319  6e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  43.12 
 
 
452 aa  318  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32660  MFS family transporter  47.93 
 
 
448 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00466329  hitchhiker  0.0000329882 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  43.16 
 
 
452 aa  317  3e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  39.06 
 
 
452 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8635  major facilitator superfamily MFS_1  46.6 
 
 
458 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0703703  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0807  major facilitator transporter  43.57 
 
 
386 aa  310  4e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  43.58 
 
 
453 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  41.08 
 
 
468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  39.73 
 
 
453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  43.16 
 
 
452 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  39.63 
 
 
452 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  39.63 
 
 
452 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  44.02 
 
 
453 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  39.59 
 
 
453 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  43.16 
 
 
452 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  43.16 
 
 
452 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  43.66 
 
 
453 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  43.66 
 
 
453 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  39.95 
 
 
453 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  43.82 
 
 
453 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  42.92 
 
 
452 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  40.33 
 
 
453 aa  297  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2526  4-hydroxybenzoate transporter  43.4 
 
 
452 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  37.64 
 
 
475 aa  295  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  39.77 
 
 
450 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  40.57 
 
 
458 aa  282  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  38.08 
 
 
454 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  38.53 
 
 
451 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  38.53 
 
 
451 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  38.53 
 
 
451 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  38.53 
 
 
451 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  38.53 
 
 
451 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  38.53 
 
 
451 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  38.3 
 
 
451 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  39.05 
 
 
454 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  38.08 
 
 
579 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  33.03 
 
 
438 aa  262  6.999999999999999e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3941  major facilitator transporter  37.26 
 
 
449 aa  259  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.939508 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4567  4-hydroxybenzoate transporter  37.7 
 
 
458 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0165748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>