More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0149 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
441 aa  848    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  46.26 
 
 
454 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  47.06 
 
 
451 aa  338  9e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  46.5 
 
 
468 aa  328  8e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  45.15 
 
 
449 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  47.55 
 
 
453 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  48.37 
 
 
453 aa  323  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  47.34 
 
 
447 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  47.9 
 
 
451 aa  317  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  47.16 
 
 
453 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  47.16 
 
 
453 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  42.18 
 
 
475 aa  312  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  47.45 
 
 
453 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  43.43 
 
 
452 aa  311  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  43.66 
 
 
452 aa  311  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  43.27 
 
 
452 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  43.27 
 
 
452 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  39.72 
 
 
455 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  42.09 
 
 
441 aa  306  6e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  43.37 
 
 
453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  43.37 
 
 
453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  43 
 
 
453 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  37.7 
 
 
438 aa  299  6e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  41.63 
 
 
451 aa  298  9e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  45.15 
 
 
452 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  45.15 
 
 
452 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  45.15 
 
 
452 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  45.15 
 
 
452 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  43 
 
 
453 aa  296  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  42.12 
 
 
452 aa  296  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  43.38 
 
 
450 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  39.67 
 
 
452 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  44.8 
 
 
457 aa  294  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  42.18 
 
 
454 aa  294  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  40.52 
 
 
454 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  42.25 
 
 
452 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  42.01 
 
 
451 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  42.01 
 
 
451 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  41.41 
 
 
449 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  40.57 
 
 
452 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  42.01 
 
 
451 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  42.01 
 
 
451 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  42.01 
 
 
451 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  42.01 
 
 
451 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  43.09 
 
 
457 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2526  4-hydroxybenzoate transporter  45.39 
 
 
452 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  42.01 
 
 
451 aa  286  8e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  43 
 
 
579 aa  285  9e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  41.86 
 
 
458 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  40.9 
 
 
465 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  40.14 
 
 
452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  40.23 
 
 
452 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  40.23 
 
 
452 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  47.14 
 
 
449 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  41.05 
 
 
448 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  41.96 
 
 
458 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  39.91 
 
 
452 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  41.05 
 
 
448 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  41.39 
 
 
448 aa  279  7e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  44.17 
 
 
458 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4030  major facilitator superfamily MFS_1  44.67 
 
 
463 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  39.07 
 
 
452 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  42.17 
 
 
449 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  38.89 
 
 
465 aa  276  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  41.49 
 
 
452 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  40.98 
 
 
452 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  40.47 
 
 
452 aa  275  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  41.5 
 
 
454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  45.65 
 
 
461 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  41.96 
 
 
456 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0807  major facilitator transporter  40.8 
 
 
386 aa  272  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  41.75 
 
 
452 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  41.25 
 
 
448 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0937  major facilitator superfamily MFS_1  38.94 
 
 
448 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.699917  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  41.9 
 
 
448 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  39.29 
 
 
455 aa  270  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  41.67 
 
 
461 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  42.71 
 
 
450 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  41 
 
 
448 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
448 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  39.76 
 
 
461 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3923  major facilitator superfamily transporter  45.26 
 
 
462 aa  266  8e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.603899  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  41.25 
 
 
454 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  41.84 
 
 
449 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  41.29 
 
 
446 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  41.92 
 
 
454 aa  264  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32660  MFS family transporter  46.95 
 
 
448 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00466329  hitchhiker  0.0000329882 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 
447 aa  263  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2748  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  41.78 
 
 
450 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  40.9 
 
 
449 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  39.01 
 
 
445 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  39.86 
 
 
447 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  43.4 
 
 
453 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38560  putative MFS transporter  41.46 
 
 
450 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020424  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  37.74 
 
 
461 aa  259  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  41.93 
 
 
449 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4011  protocatechuate (4-hydroxybenzoate) transmembrane transporter  42.68 
 
 
459 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  39.52 
 
 
459 aa  256  7e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3283  MFS family transporter  41.46 
 
 
450 aa  256  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170295  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6390  major facilitator transporter  42.31 
 
 
467 aa  256  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.536228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>