More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4260 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  100 
 
 		 461 aa  900    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6469  benzoate transport  50 
 
 		 460 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6628  major facilitator transporter  43.79 
 
 		 460 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.990266 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6395  major facilitator transporter  43.79 
 
 		 460 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6226  major facilitator transporter  43.82 
 
 		 460 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6623  major facilitator transporter  44.1 
 
 		 467 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6390  major facilitator transporter  44.1 
 
 		 467 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.536228  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6221  major facilitator transporter  43.86 
 
 		 467 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  39.74 
 
 		 461 aa  312  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  37.64 
 
 		 454 aa  274  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2519  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  39.23 
 
 		 452 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 438 aa  259  5.0000000000000005e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  37.75 
 
 		 453 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  37.47 
 
 		 445 aa  256  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 453 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  37.81 
 
 		 450 aa  254  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  37.11 
 
 		 451 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  37.11 
 
 		 451 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  36.95 
 
 		 453 aa  249  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  35.57 
 
 		 455 aa  249  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  36.89 
 
 		 451 aa  249  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  36.89 
 
 		 451 aa  249  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  36.89 
 
 		 451 aa  249  9e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  36.89 
 
 		 451 aa  249  9e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  36.12 
 
 		 451 aa  247  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  36.97 
 
 		 451 aa  246  9e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  36.69 
 
 		 579 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  36.18 
 
 		 454 aa  243  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  36.61 
 
 		 454 aa  237  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4030  major facilitator superfamily MFS_1  38.76 
 
 		 463 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  33.55 
 
 		 475 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 		 461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4904  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 446 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 		 451 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3923  major facilitator superfamily transporter  39.45 
 
 		 462 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.603899  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  37.66 
 
 		 441 aa  225  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  30.8 
 
 		 447 aa  225  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 447 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 449 aa  223  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 454 aa  222  9e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2625  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  34.66 
 
 		 466 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000676448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4528  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  34.66 
 
 		 466 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000028085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 454 aa  221  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  37.31 
 
 		 448 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  32.13 
 
 		 441 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  37.56 
 
 		 448 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 453 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  35.67 
 
 		 453 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 453 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  37.31 
 
 		 448 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 458 aa  216  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 451 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20360  major facilitator superfamily (MFS) permease  34.76 
 
 		 432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 452 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  36.1 
 
 		 448 aa  213  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  34.81 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  32.46 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 452 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 452 aa  210  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 452 aa  209  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  33.33 
 
 		 458 aa  209  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 452 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.63 
 
 		 465 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 449 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 443 aa  207  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  31.26 
 
 		 468 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 453 aa  206  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 		 451 aa  206  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  36.57 
 
 		 447 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 456 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  36.1 
 
 		 448 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.8 
 
 		 452 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 452 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 448 aa  203  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 461 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6499  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 449 aa  203  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 453 aa  202  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8635  major facilitator superfamily MFS_1  36.25 
 
 		 458 aa  202  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0703703  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  30.95 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  36.36 
 
 		 458 aa  201  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  33.04 
 
 		 446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 454 aa  200  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  35.85 
 
 		 448 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  30.57 
 
 		 452 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 454 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 449 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 465 aa  196  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>