More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0717 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  96.03 
 
 		 452 aa  851    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  83.15 
 
 		 451 aa  716    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  83.15 
 
 		 451 aa  716    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  83.15 
 
 		 451 aa  716    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  80.27 
 
 		 454 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  100 
 
 		 453 aa  885    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  83.15 
 
 		 451 aa  716    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  93.57 
 
 		 450 aa  799    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  83.15 
 
 		 451 aa  717    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  82.93 
 
 		 451 aa  712    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  95.81 
 
 		 453 aa  830    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  83.15 
 
 		 451 aa  717    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  84.62 
 
 		 579 aa  688    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  79.52 
 
 		 454 aa  658    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  96.91 
 
 		 453 aa  861    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  96.03 
 
 		 452 aa  851    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  99.12 
 
 		 453 aa  879    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  56.56 
 
 		 455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4030  major facilitator superfamily MFS_1  51.16 
 
 		 463 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  45.82 
 
 		 438 aa  363  3e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  51.61 
 
 		 461 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  44.57 
 
 		 475 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3923  major facilitator superfamily transporter  51.89 
 
 		 462 aa  336  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.603899  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4904  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 446 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  43.05 
 
 		 454 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 451 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  40 
 
 		 448 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  40 
 
 		 448 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 452 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  41.08 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 447 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  43.23 
 
 		 457 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 		 452 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  40.33 
 
 		 448 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  40.1 
 
 		 448 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  39.45 
 
 		 449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  37.92 
 
 		 461 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  37.91 
 
 		 457 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  43.29 
 
 		 451 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  40.81 
 
 		 447 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  39.54 
 
 		 465 aa  280  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  41.56 
 
 		 452 aa  279  7e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  41.36 
 
 		 458 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  37.09 
 
 		 452 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  41.36 
 
 		 449 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  41.96 
 
 		 454 aa  278  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  43.78 
 
 		 441 aa  276  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 461 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  37.62 
 
 		 452 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  37.38 
 
 		 452 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2748  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  39.51 
 
 		 450 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  40.94 
 
 		 453 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 449 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  39.81 
 
 		 448 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  37.85 
 
 		 451 aa  270  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  36.34 
 
 		 441 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  41.04 
 
 		 443 aa  270  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 453 aa  270  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  40 
 
 		 456 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  39.9 
 
 		 448 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  40.94 
 
 		 442 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  40.94 
 
 		 442 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2625  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  38.12 
 
 		 466 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000676448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4528  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  38.12 
 
 		 466 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000028085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  40.47 
 
 		 440 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  39.13 
 
 		 458 aa  266  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4450  major facilitator transporter  41.5 
 
 		 460 aa  266  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489654  normal  0.0331479 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  40.71 
 
 		 442 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 449 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  37.41 
 
 		 465 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  38.28 
 
 		 458 aa  265  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  41.11 
 
 		 465 aa  264  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  37.35 
 
 		 452 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 452 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 452 aa  263  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 452 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 452 aa  262  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  38.12 
 
 		 445 aa  262  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 454 aa  261  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  40.65 
 
 		 453 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  40.65 
 
 		 453 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  35.7 
 
 		 454 aa  260  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  37.03 
 
 		 449 aa  259  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 468 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0807  major facilitator transporter  41.58 
 
 		 386 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  37.75 
 
 		 461 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  35.19 
 
 		 452 aa  256  6e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  37.78 
 
 		 453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2124  benzoate transport  40.43 
 
 		 449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798093  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  38.02 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  40.18 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  35.65 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4011  protocatechuate (4-hydroxybenzoate) transmembrane transporter  40.61 
 
 		 459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  35.43 
 
 		 458 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1205  4-hydroxybenzoate transporter  41.91 
 
 		 451 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0050  4-hydroxybenzoate transporter  41.91 
 
 		 451 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1488  4-hydroxybenzoate transporter  41.91 
 
 		 451 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0061  4-hydroxybenzoate transporter  41.91 
 
 		 451 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586422  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 449 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>