More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2748 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2748  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  100 
 
 
450 aa  882    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6499  major facilitator transporter  46.88 
 
 
449 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270044  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3242  major facilitator transporter  46.19 
 
 
449 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4921  major facilitator transporter  45.96 
 
 
449 aa  349  7e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  40.2 
 
 
450 aa  295  8e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  38.43 
 
 
453 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  38.43 
 
 
453 aa  293  6e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  38.43 
 
 
453 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  38.19 
 
 
452 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  38.19 
 
 
452 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  38.89 
 
 
448 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  38.89 
 
 
448 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  39.95 
 
 
448 aa  282  9e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  39.9 
 
 
448 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  38.66 
 
 
451 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  38.66 
 
 
451 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  38.66 
 
 
451 aa  279  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  38.66 
 
 
451 aa  279  6e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  38.66 
 
 
451 aa  279  6e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  38.66 
 
 
451 aa  279  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  42.23 
 
 
448 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  38.6 
 
 
451 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  42.48 
 
 
448 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  42.02 
 
 
452 aa  277  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  38.96 
 
 
453 aa  276  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  38.69 
 
 
454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  38.14 
 
 
579 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  39.77 
 
 
454 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  39.41 
 
 
451 aa  269  8e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  37.83 
 
 
475 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  38.68 
 
 
454 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  41.95 
 
 
441 aa  268  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  34.8 
 
 
455 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  38.34 
 
 
447 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  36.18 
 
 
454 aa  264  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  35.59 
 
 
461 aa  263  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  34.64 
 
 
438 aa  261  1e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  40.14 
 
 
449 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  36.61 
 
 
465 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  40.2 
 
 
465 aa  259  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  40.05 
 
 
458 aa  257  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  39.91 
 
 
451 aa  256  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  40.37 
 
 
457 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  35.86 
 
 
451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  39.63 
 
 
453 aa  253  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  37.64 
 
 
447 aa  252  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  42.78 
 
 
449 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1488  4-hydroxybenzoate transporter  42.02 
 
 
451 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0050  4-hydroxybenzoate transporter  42.02 
 
 
451 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1205  4-hydroxybenzoate transporter  42.02 
 
 
451 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0061  4-hydroxybenzoate transporter  42.02 
 
 
451 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586422  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  36.08 
 
 
449 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  35.65 
 
 
452 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  38.13 
 
 
457 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  36.99 
 
 
449 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2124  benzoate transport  40.87 
 
 
449 aa  245  9e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798093  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  36.87 
 
 
452 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  37.11 
 
 
452 aa  245  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  39.2 
 
 
453 aa  246  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3530  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  35.54 
 
 
464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244381  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  36.3 
 
 
452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  36.63 
 
 
452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  38.36 
 
 
458 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0072  4-hydroxybenzoate transporter  42.25 
 
 
451 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279221  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  37.07 
 
 
468 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0059  4-hydroxybenzoate transporter  42.25 
 
 
451 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1558  4-hydroxybenzoate transporter  42.25 
 
 
451 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6623  major facilitator transporter  35.76 
 
 
467 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6390  major facilitator transporter  35.76 
 
 
467 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.536228  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6221  major facilitator transporter  35.54 
 
 
467 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  37.82 
 
 
453 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  37.82 
 
 
453 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  37.25 
 
 
453 aa  240  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  36.16 
 
 
461 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  34.82 
 
 
448 aa  238  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  36.06 
 
 
452 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  35.35 
 
 
449 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  36.06 
 
 
452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  36.06 
 
 
452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  36.06 
 
 
452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  35.62 
 
 
449 aa  234  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32660  MFS family transporter  39.64 
 
 
448 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00466329  hitchhiker  0.0000329882 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  34.22 
 
 
452 aa  233  6e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6226  major facilitator transporter  35.23 
 
 
460 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  35.63 
 
 
452 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6469  benzoate transport  34.66 
 
 
460 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  38.07 
 
 
453 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6628  major facilitator transporter  35.23 
 
 
460 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.990266 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6395  major facilitator transporter  35.23 
 
 
460 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  36.05 
 
 
458 aa  230  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  33.26 
 
 
441 aa  229  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  35.35 
 
 
456 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  35.63 
 
 
452 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  36.57 
 
 
452 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4011  protocatechuate (4-hydroxybenzoate) transmembrane transporter  37.41 
 
 
459 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8635  major facilitator superfamily MFS_1  41.56 
 
 
458 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0703703  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  31.77 
 
 
447 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  35.83 
 
 
452 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  35.83 
 
 
452 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4904  major facilitator transporter  37.44 
 
 
446 aa  223  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>