More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0741 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  100 
 
 		 438 aa  865    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  45.82 
 
 		 453 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  45.93 
 
 		 453 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  45.69 
 
 		 453 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  45.69 
 
 		 452 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  45.69 
 
 		 452 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  48.45 
 
 		 450 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  41.72 
 
 		 455 aa  350  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  47.68 
 
 		 453 aa  350  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  47.69 
 
 		 454 aa  342  9e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  42.73 
 
 		 451 aa  339  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  42.73 
 
 		 451 aa  339  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  42.62 
 
 		 451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  42.62 
 
 		 451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  42.62 
 
 		 451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  42.62 
 
 		 451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  42.5 
 
 		 451 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  44.72 
 
 		 579 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  48.2 
 
 		 454 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  37.02 
 
 		 475 aa  293  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  39.01 
 
 		 461 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4030  major facilitator superfamily MFS_1  38.57 
 
 		 463 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4904  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3923  major facilitator superfamily transporter  39.21 
 
 		 462 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.603899  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  38.43 
 
 		 451 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 449 aa  262  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  35.67 
 
 		 454 aa  262  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  35.15 
 
 		 458 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  37.62 
 
 		 441 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  34.11 
 
 		 461 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 449 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  36.11 
 
 		 449 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 		 448 aa  257  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  35.83 
 
 		 450 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  34.35 
 
 		 465 aa  250  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 		 447 aa  249  7e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 453 aa  249  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  34.98 
 
 		 453 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 447 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  32.72 
 
 		 441 aa  246  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  36.09 
 
 		 448 aa  245  9e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 454 aa  245  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  34.19 
 
 		 448 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  35.98 
 
 		 458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  35.24 
 
 		 448 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  35.03 
 
 		 451 aa  242  7e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  33.95 
 
 		 448 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 453 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 453 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 465 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 454 aa  239  5e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2748  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  34.64 
 
 		 450 aa  239  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  34.98 
 
 		 456 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  37.04 
 
 		 451 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 452 aa  238  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  35.5 
 
 		 443 aa  238  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6469  benzoate transport  35.24 
 
 		 460 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 468 aa  236  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 453 aa  236  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 449 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 449 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  33.5 
 
 		 455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  35.32 
 
 		 449 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  33.65 
 
 		 452 aa  234  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 		 458 aa  233  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  34.45 
 
 		 445 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  31.52 
 
 		 454 aa  232  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  33.87 
 
 		 452 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 455 aa  232  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  34.27 
 
 		 447 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 452 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  32.21 
 
 		 452 aa  231  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.21 
 
 		 461 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8635  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 		 458 aa  229  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0703703  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 452 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 452 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6499  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 449 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  34.16 
 
 		 448 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  34.16 
 
 		 448 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 454 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 458 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 459 aa  226  6e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6628  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 460 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.990266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3283  MFS family transporter  35.27 
 
 		 450 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170295  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 450 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6226  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 460 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6395  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 460 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  33.93 
 
 		 446 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  34.35 
 
 		 446 aa  224  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  32.78 
 
 		 450 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38560  putative MFS transporter  35.01 
 
 		 450 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.65 
 
 		 465 aa  223  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  34.43 
 
 		 449 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 454 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>