More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1093 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  100 
 
 		 454 aa  880    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  54.82 
 
 		 451 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  50 
 
 		 449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  55.99 
 
 		 451 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  52.9 
 
 		 453 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  51.29 
 
 		 468 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  51.87 
 
 		 447 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  53.36 
 
 		 453 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  53.36 
 
 		 453 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  52.9 
 
 		 453 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  54.13 
 
 		 457 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  54.84 
 
 		 449 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  54.17 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  45.87 
 
 		 441 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  48.17 
 
 		 452 aa  372  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  47.71 
 
 		 452 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  47.53 
 
 		 457 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  49.88 
 
 		 452 aa  362  9e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  49.88 
 
 		 452 aa  362  9e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  46.65 
 
 		 451 aa  361  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  49.88 
 
 		 452 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  49.88 
 
 		 452 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  48.98 
 
 		 446 aa  360  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  42.19 
 
 		 449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32660  MFS family transporter  53.7 
 
 		 448 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00466329  hitchhiker  0.0000329882 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  47.9 
 
 		 452 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  44.86 
 
 		 454 aa  349  7e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2526  4-hydroxybenzoate transporter  50.59 
 
 		 452 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  44.39 
 
 		 452 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  41.53 
 
 		 452 aa  340  4e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  45.16 
 
 		 465 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  45.79 
 
 		 449 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  45.35 
 
 		 448 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  45.94 
 
 		 456 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  44.69 
 
 		 461 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  45.35 
 
 		 448 aa  330  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  45.35 
 
 		 448 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  49.16 
 
 		 448 aa  328  8e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  40.13 
 
 		 447 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  42.79 
 
 		 475 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  46.19 
 
 		 455 aa  327  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  42.03 
 
 		 448 aa  327  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  45.28 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  48.92 
 
 		 448 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  45.73 
 
 		 449 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  42.98 
 
 		 449 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4011  protocatechuate (4-hydroxybenzoate) transmembrane transporter  45.47 
 
 		 459 aa  322  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  46.45 
 
 		 448 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0050  4-hydroxybenzoate transporter  47.75 
 
 		 451 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1488  4-hydroxybenzoate transporter  47.75 
 
 		 451 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0061  4-hydroxybenzoate transporter  47.75 
 
 		 451 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586422  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1205  4-hydroxybenzoate transporter  47.75 
 
 		 451 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  43.48 
 
 		 458 aa  320  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  45.35 
 
 		 447 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  46.44 
 
 		 458 aa  319  7.999999999999999e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  45.41 
 
 		 449 aa  317  4e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  41.91 
 
 		 452 aa  316  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 453 aa  317  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0059  4-hydroxybenzoate transporter  47.97 
 
 		 451 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1558  4-hydroxybenzoate transporter  47.97 
 
 		 451 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 452 aa  315  7e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  42.47 
 
 		 459 aa  313  3.9999999999999997e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0072  4-hydroxybenzoate transporter  47.75 
 
 		 451 aa  312  9e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279221  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  42.02 
 
 		 452 aa  310  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  40.54 
 
 		 452 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  40.54 
 
 		 452 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  42.07 
 
 		 452 aa  309  8e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  40.54 
 
 		 452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  42.07 
 
 		 452 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  40.22 
 
 		 452 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 452 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4450  major facilitator transporter  42.76 
 
 		 460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489654  normal  0.0331479 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  43.15 
 
 		 450 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  46.85 
 
 		 441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  43.86 
 
 		 454 aa  302  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2124  benzoate transport  46.14 
 
 		 449 aa  295  8e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798093  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 452 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20360  major facilitator superfamily (MFS) permease  42.57 
 
 		 432 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  40.71 
 
 		 465 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 452 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 453 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3941  major facilitator transporter  43.46 
 
 		 449 aa  293  6e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.939508 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  41.08 
 
 		 453 aa  292  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  41.08 
 
 		 453 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0807  major facilitator transporter  41.86 
 
 		 386 aa  290  4e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 450 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  40.27 
 
 		 453 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  40.8 
 
 		 455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6221  major facilitator transporter  39.15 
 
 		 467 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  42.01 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8635  major facilitator superfamily MFS_1  47.07 
 
 		 458 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0703703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6623  major facilitator transporter  38.93 
 
 		 467 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6390  major facilitator transporter  38.93 
 
 		 467 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.536228  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  40.61 
 
 		 451 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  40.61 
 
 		 451 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  40.61 
 
 		 451 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  40.61 
 
 		 451 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  40.61 
 
 		 451 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  40.61 
 
 		 451 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  40.61 
 
 		 451 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>