More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2512 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  100 
 
 		 452 aa  899    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  65.38 
 
 		 448 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  62.13 
 
 		 447 aa  553  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  54.11 
 
 		 461 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  54.52 
 
 		 449 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20360  major facilitator superfamily (MFS) permease  53.74 
 
 		 432 aa  423  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  51.54 
 
 		 465 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  46.8 
 
 		 465 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  46.17 
 
 		 451 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  43.22 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  45.35 
 
 		 449 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  44.55 
 
 		 448 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  45.69 
 
 		 448 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  44.55 
 
 		 448 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  45.24 
 
 		 447 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  46.37 
 
 		 457 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  44.78 
 
 		 448 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  45.45 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  45.62 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  45.58 
 
 		 452 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  47.58 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  45.25 
 
 		 449 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  46.62 
 
 		 448 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  46.38 
 
 		 448 aa  359  4e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  41.53 
 
 		 454 aa  358  9e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  45.5 
 
 		 458 aa  358  9.999999999999999e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  47.1 
 
 		 446 aa  356  3.9999999999999996e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  46.6 
 
 		 450 aa  350  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  46.65 
 
 		 451 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  41.63 
 
 		 452 aa  345  7e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  43.26 
 
 		 447 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  47.73 
 
 		 449 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 458 aa  340  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  46.48 
 
 		 459 aa  340  4e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2124  benzoate transport  47.58 
 
 		 449 aa  338  8e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798093  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  42.39 
 
 		 452 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 452 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 452 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 452 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 452 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4011  protocatechuate (4-hydroxybenzoate) transmembrane transporter  45.21 
 
 		 459 aa  336  5.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  42.31 
 
 		 452 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  42.07 
 
 		 452 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 453 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  42.13 
 
 		 452 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  43.79 
 
 		 453 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  43.79 
 
 		 453 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  43.6 
 
 		 458 aa  332  7.000000000000001e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  41.59 
 
 		 452 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0050  4-hydroxybenzoate transporter  44.9 
 
 		 451 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0061  4-hydroxybenzoate transporter  44.9 
 
 		 451 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586422  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1205  4-hydroxybenzoate transporter  44.9 
 
 		 451 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1488  4-hydroxybenzoate transporter  44.9 
 
 		 451 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  39.77 
 
 		 449 aa  330  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  46.14 
 
 		 449 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  43.78 
 
 		 454 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  43.85 
 
 		 457 aa  325  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  42.17 
 
 		 453 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  45.16 
 
 		 456 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0072  4-hydroxybenzoate transporter  44.9 
 
 		 451 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279221  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  42.66 
 
 		 453 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 452 aa  318  9e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  41.41 
 
 		 452 aa  318  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0059  4-hydroxybenzoate transporter  44.44 
 
 		 451 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0807  major facilitator transporter  43.83 
 
 		 386 aa  318  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1558  4-hydroxybenzoate transporter  44.44 
 
 		 451 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  42.09 
 
 		 453 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32660  MFS family transporter  45.27 
 
 		 448 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00466329  hitchhiker  0.0000329882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4450  major facilitator transporter  43.45 
 
 		 460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489654  normal  0.0331479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 455 aa  313  4.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  40.61 
 
 		 468 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  41.98 
 
 		 452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  41.98 
 
 		 452 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  41.98 
 
 		 452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  41.98 
 
 		 452 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2526  4-hydroxybenzoate transporter  42.22 
 
 		 452 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  38.83 
 
 		 452 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8635  major facilitator superfamily MFS_1  44.6 
 
 		 458 aa  293  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0703703  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 452 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 452 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 453 aa  269  7e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  35.55 
 
 		 453 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  35.65 
 
 		 453 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  35.63 
 
 		 453 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  37.65 
 
 		 458 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  35.23 
 
 		 450 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  34.88 
 
 		 475 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  35.97 
 
 		 451 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  35.97 
 
 		 451 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  35.48 
 
 		 451 aa  256  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  35.48 
 
 		 451 aa  256  8e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  35.48 
 
 		 451 aa  256  8e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  35.48 
 
 		 451 aa  256  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  35.97 
 
 		 451 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  41.15 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3941  major facilitator transporter  36.65 
 
 		 449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.939508 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 438 aa  254  3e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  36.63 
 
 		 454 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  35.97 
 
 		 579 aa  249  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4567  4-hydroxybenzoate transporter  36.21 
 
 		 458 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0165748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>