More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0807 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0807  major facilitator transporter  100 
 
 
386 aa  771    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  53.11 
 
 
451 aa  411  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  53.77 
 
 
457 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  49.48 
 
 
454 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4011  protocatechuate (4-hydroxybenzoate) transmembrane transporter  52.6 
 
 
459 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  45.08 
 
 
452 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  50.26 
 
 
455 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  48.68 
 
 
448 aa  360  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  48.84 
 
 
452 aa  359  3e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  49.1 
 
 
458 aa  359  4e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  46.72 
 
 
448 aa  358  8e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  46.72 
 
 
448 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  46.98 
 
 
448 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  44.3 
 
 
452 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  44.3 
 
 
452 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  48.42 
 
 
458 aa  349  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  44.3 
 
 
452 aa  349  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  48.58 
 
 
454 aa  349  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  44.3 
 
 
452 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  46.84 
 
 
447 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  47.63 
 
 
449 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  44.56 
 
 
452 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  44.56 
 
 
452 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  44.56 
 
 
452 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  46.98 
 
 
448 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  43.78 
 
 
452 aa  332  8e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  46.98 
 
 
448 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  43.78 
 
 
452 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  45.22 
 
 
453 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4450  major facilitator transporter  46.65 
 
 
460 aa  322  5e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489654  normal  0.0331479 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  43.83 
 
 
452 aa  322  5e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0061  4-hydroxybenzoate transporter  48.56 
 
 
451 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586422  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0050  4-hydroxybenzoate transporter  48.56 
 
 
451 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1205  4-hydroxybenzoate transporter  48.56 
 
 
451 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1488  4-hydroxybenzoate transporter  48.56 
 
 
451 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  48.68 
 
 
456 aa  319  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  45.29 
 
 
461 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  42.3 
 
 
441 aa  315  8e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  43.01 
 
 
449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  46.77 
 
 
447 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2124  benzoate transport  47.64 
 
 
449 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798093  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1558  4-hydroxybenzoate transporter  47.52 
 
 
451 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0059  4-hydroxybenzoate transporter  47.52 
 
 
451 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0072  4-hydroxybenzoate transporter  47.78 
 
 
451 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279221  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  43.92 
 
 
465 aa  308  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  41.86 
 
 
454 aa  307  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  43.78 
 
 
449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  39.64 
 
 
449 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  43.72 
 
 
449 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  41.56 
 
 
465 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  45.99 
 
 
449 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 
451 aa  299  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  40.89 
 
 
448 aa  296  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  42.01 
 
 
447 aa  296  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4567  4-hydroxybenzoate transporter  40.42 
 
 
458 aa  296  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0165748  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  42.38 
 
 
449 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  44.21 
 
 
452 aa  293  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  41.97 
 
 
446 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  44.21 
 
 
452 aa  293  5e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  43.78 
 
 
459 aa  292  5e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  39.18 
 
 
458 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  43.64 
 
 
457 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  43.26 
 
 
453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8635  major facilitator superfamily MFS_1  45.05 
 
 
458 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0703703  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32660  MFS family transporter  46.09 
 
 
448 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00466329  hitchhiker  0.0000329882 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  43.26 
 
 
453 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  43.26 
 
 
453 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  43.41 
 
 
451 aa  278  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20360  major facilitator superfamily (MFS) permease  42.97 
 
 
432 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  40.89 
 
 
453 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  41.58 
 
 
453 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  43.67 
 
 
453 aa  276  6e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  41.3 
 
 
453 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  40.62 
 
 
452 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  40.62 
 
 
452 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  40.16 
 
 
450 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  43.27 
 
 
452 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  43.27 
 
 
452 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  43.27 
 
 
452 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  43.27 
 
 
452 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  40.62 
 
 
453 aa  269  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  36.86 
 
 
452 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  39.84 
 
 
450 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  40.21 
 
 
468 aa  263  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  41.45 
 
 
453 aa  262  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2526  4-hydroxybenzoate transporter  43.27 
 
 
452 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  40.8 
 
 
441 aa  262  8.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  37.34 
 
 
458 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3941  major facilitator transporter  39.64 
 
 
449 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.939508 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  35.48 
 
 
455 aa  243  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  36.1 
 
 
475 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  39.53 
 
 
451 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  39.53 
 
 
451 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  39.53 
 
 
451 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  39.53 
 
 
451 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  39.53 
 
 
451 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  39.53 
 
 
451 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  39.53 
 
 
451 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  38.9 
 
 
579 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  34.99 
 
 
465 aa  226  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>