More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_31240 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  100 
 
 
446 aa  872    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  75.06 
 
 
449 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  55.58 
 
 
449 aa  478  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  55.18 
 
 
441 aa  477  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  55.88 
 
 
449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  56.88 
 
 
450 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  54.88 
 
 
459 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  49.89 
 
 
451 aa  421  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  51.37 
 
 
448 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  51.37 
 
 
448 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  51.73 
 
 
448 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  48.98 
 
 
454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  52.39 
 
 
452 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  53.24 
 
 
458 aa  405  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  52.91 
 
 
448 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  51.96 
 
 
447 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  50.81 
 
 
457 aa  395  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  54.05 
 
 
449 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  53.81 
 
 
448 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  47.66 
 
 
465 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  54.05 
 
 
448 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  47.1 
 
 
452 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  45.29 
 
 
448 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  46.07 
 
 
454 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2124  benzoate transport  53.33 
 
 
449 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798093  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  49.43 
 
 
456 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  48.09 
 
 
447 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  43.69 
 
 
452 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  43.85 
 
 
449 aa  363  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  49.03 
 
 
461 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  49.32 
 
 
449 aa  359  6e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0050  4-hydroxybenzoate transporter  53 
 
 
451 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0061  4-hydroxybenzoate transporter  53 
 
 
451 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586422  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1488  4-hydroxybenzoate transporter  53 
 
 
451 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1205  4-hydroxybenzoate transporter  53 
 
 
451 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 
447 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  44.89 
 
 
452 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  48.1 
 
 
453 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4011  protocatechuate (4-hydroxybenzoate) transmembrane transporter  49.88 
 
 
459 aa  353  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  42.96 
 
 
452 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  49.07 
 
 
453 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  49.07 
 
 
453 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1558  4-hydroxybenzoate transporter  52.76 
 
 
451 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0059  4-hydroxybenzoate transporter  52.76 
 
 
451 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0072  4-hydroxybenzoate transporter  52.76 
 
 
451 aa  349  6e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279221  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  45.68 
 
 
458 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4450  major facilitator transporter  47.59 
 
 
460 aa  346  6e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489654  normal  0.0331479 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  48.59 
 
 
453 aa  346  6e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  44.34 
 
 
452 aa  346  6e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  44.34 
 
 
452 aa  345  7e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  46.08 
 
 
455 aa  345  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  44.7 
 
 
451 aa  342  9e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  44.74 
 
 
465 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  43.54 
 
 
453 aa  339  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  43.44 
 
 
452 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  51.05 
 
 
449 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  48.25 
 
 
457 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  43.44 
 
 
452 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  47.81 
 
 
453 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  42.47 
 
 
452 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  45.05 
 
 
452 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  45.05 
 
 
452 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  45.05 
 
 
452 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  45.05 
 
 
452 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  41.97 
 
 
452 aa  332  8e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  42.2 
 
 
452 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  42.2 
 
 
452 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  42.2 
 
 
452 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  45.37 
 
 
454 aa  330  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20360  major facilitator superfamily (MFS) permease  44.97 
 
 
432 aa  326  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2526  4-hydroxybenzoate transporter  45.05 
 
 
452 aa  326  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32660  MFS family transporter  50.82 
 
 
448 aa  323  6e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00466329  hitchhiker  0.0000329882 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  45.41 
 
 
468 aa  322  7e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  45.66 
 
 
451 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8635  major facilitator superfamily MFS_1  49.24 
 
 
458 aa  310  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0703703  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  40.24 
 
 
458 aa  310  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  41.15 
 
 
452 aa  309  8e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0807  major facilitator transporter  41.97 
 
 
386 aa  302  9e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  42.38 
 
 
458 aa  300  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  41.74 
 
 
465 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  38.05 
 
 
475 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4567  4-hydroxybenzoate transporter  39.82 
 
 
458 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0165748  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  38.02 
 
 
453 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  38.13 
 
 
452 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  38.13 
 
 
452 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  38.02 
 
 
453 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  38.13 
 
 
453 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3941  major facilitator transporter  38.6 
 
 
449 aa  270  5.9999999999999995e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.939508 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  37.9 
 
 
450 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  37.9 
 
 
453 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  37.47 
 
 
451 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  37.47 
 
 
451 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  41.75 
 
 
441 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  37.47 
 
 
451 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  37.47 
 
 
451 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  37.47 
 
 
451 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  37.47 
 
 
451 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  33.8 
 
 
438 aa  260  4e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  37.47 
 
 
451 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38560  putative MFS transporter  41.77 
 
 
450 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020424  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>