More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6034 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  100 
 
 		 458 aa  900    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  41.26 
 
 		 452 aa  341  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  42.53 
 
 		 461 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 465 aa  339  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  40.97 
 
 		 449 aa  338  9e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  42.04 
 
 		 449 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  40.37 
 
 		 448 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  41.13 
 
 		 448 aa  315  8e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  38.72 
 
 		 447 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  38.93 
 
 		 465 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  40.93 
 
 		 441 aa  313  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  40.09 
 
 		 448 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 459 aa  312  6.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  40.72 
 
 		 450 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  41.07 
 
 		 449 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  38.57 
 
 		 451 aa  311  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 454 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  40.67 
 
 		 449 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  39.86 
 
 		 448 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  39.26 
 
 		 458 aa  301  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  40.14 
 
 		 447 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  40.1 
 
 		 448 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  40.19 
 
 		 448 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  36.6 
 
 		 452 aa  293  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  34.49 
 
 		 452 aa  292  7e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  41.91 
 
 		 456 aa  292  9e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  39.95 
 
 		 448 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20360  major facilitator superfamily (MFS) permease  38.03 
 
 		 432 aa  290  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  34.14 
 
 		 452 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  40 
 
 		 446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 452 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  40 
 
 		 452 aa  282  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  39.06 
 
 		 447 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 452 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  37.27 
 
 		 455 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  38.99 
 
 		 451 aa  280  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  38.59 
 
 		 449 aa  277  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0807  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 386 aa  276  5e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 452 aa  276  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 452 aa  276  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 452 aa  276  7e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 452 aa  276  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  39.8 
 
 		 449 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  35.67 
 
 		 458 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  40.64 
 
 		 453 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  39.82 
 
 		 453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 452 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  37.27 
 
 		 454 aa  269  8e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  35.89 
 
 		 453 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  35.87 
 
 		 454 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  40.83 
 
 		 453 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  40.83 
 
 		 453 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 452 aa  261  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  35.35 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  39.68 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  36.61 
 
 		 468 aa  261  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  40.5 
 
 		 453 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4011  protocatechuate (4-hydroxybenzoate) transmembrane transporter  39.09 
 
 		 459 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  34 
 
 		 475 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  39.29 
 
 		 449 aa  253  7e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  35.81 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  37.01 
 
 		 458 aa  250  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1488  4-hydroxybenzoate transporter  39.54 
 
 		 451 aa  246  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0050  4-hydroxybenzoate transporter  39.54 
 
 		 451 aa  246  8e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0061  4-hydroxybenzoate transporter  39.54 
 
 		 451 aa  246  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586422  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1205  4-hydroxybenzoate transporter  39.54 
 
 		 451 aa  246  8e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4450  major facilitator transporter  36.28 
 
 		 460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489654  normal  0.0331479 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  34.42 
 
 		 452 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  34.42 
 
 		 452 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  34.42 
 
 		 452 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2124  benzoate transport  37.98 
 
 		 449 aa  243  7e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798093  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  34.42 
 
 		 452 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0072  4-hydroxybenzoate transporter  40 
 
 		 451 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279221  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8635  major facilitator superfamily MFS_1  40.81 
 
 		 458 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0703703  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  33.03 
 
 		 454 aa  239  8e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0059  4-hydroxybenzoate transporter  39.77 
 
 		 451 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1558  4-hydroxybenzoate transporter  39.77 
 
 		 451 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2526  4-hydroxybenzoate transporter  34.42 
 
 		 452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32660  MFS family transporter  38.96 
 
 		 448 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00466329  hitchhiker  0.0000329882 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3941  major facilitator transporter  36.47 
 
 		 449 aa  233  7.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.939508 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  31.86 
 
 		 461 aa  226  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 453 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 453 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 453 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 452 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 452 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 		 461 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  34.11 
 
 		 455 aa  221  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 453 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.3 
 
 		 461 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 450 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6499  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 449 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6221  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 467 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4030  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 		 463 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6623  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 467 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6390  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 467 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.536228  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  34.36 
 
 		 579 aa  208  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>