More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0779 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  78.33 
 
 
451 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  78.33 
 
 
451 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  78.33 
 
 
451 aa  663    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  80.71 
 
 
453 aa  707    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  78.33 
 
 
451 aa  665    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  78.33 
 
 
451 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
454 aa  884    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  80.72 
 
 
450 aa  685    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  78.33 
 
 
451 aa  665    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  78.33 
 
 
451 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  80.27 
 
 
453 aa  706    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  80.49 
 
 
453 aa  682    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  79.18 
 
 
579 aa  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  80.49 
 
 
452 aa  705    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  94.27 
 
 
454 aa  793    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  80.49 
 
 
452 aa  705    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  80.27 
 
 
453 aa  704    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  56.51 
 
 
455 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  46.23 
 
 
438 aa  362  9e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  43.57 
 
 
475 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4030  major facilitator superfamily MFS_1  49.42 
 
 
463 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  49.03 
 
 
461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3923  major facilitator superfamily transporter  49.26 
 
 
462 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.603899  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  40.5 
 
 
454 aa  296  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  41.63 
 
 
451 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4904  major facilitator transporter  43.1 
 
 
446 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  42.79 
 
 
457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  40.37 
 
 
447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  39.27 
 
 
448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  40.1 
 
 
448 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  39.91 
 
 
454 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  41.59 
 
 
452 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  36.34 
 
 
461 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  38.94 
 
 
452 aa  279  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  37.76 
 
 
452 aa  279  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  40.1 
 
 
448 aa  279  9e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  37.84 
 
 
449 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  37.05 
 
 
452 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  40.69 
 
 
448 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  38.7 
 
 
452 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  38.9 
 
 
465 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  38.36 
 
 
451 aa  275  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  39.59 
 
 
447 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  38.86 
 
 
458 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  38.12 
 
 
449 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  36.81 
 
 
441 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  38.85 
 
 
452 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  36.36 
 
 
452 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  38.98 
 
 
452 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2748  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  38.2 
 
 
450 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  41.02 
 
 
448 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  40.29 
 
 
448 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  42 
 
 
453 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  36.62 
 
 
457 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  38.99 
 
 
453 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  38.75 
 
 
452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  41.03 
 
 
454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  38.75 
 
 
452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  36.44 
 
 
461 aa  266  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  41.29 
 
 
441 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  36.92 
 
 
449 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  40.22 
 
 
453 aa  264  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  38.75 
 
 
452 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  40.89 
 
 
451 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  39.49 
 
 
456 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  41.53 
 
 
453 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  41.53 
 
 
453 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  37.53 
 
 
445 aa  260  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  39.31 
 
 
449 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4450  major facilitator transporter  39.48 
 
 
460 aa  260  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489654  normal  0.0331479 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  40 
 
 
468 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  38.5 
 
 
461 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  35.45 
 
 
454 aa  257  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  39.01 
 
 
449 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  40.25 
 
 
465 aa  254  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  40.72 
 
 
453 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  36.08 
 
 
452 aa  253  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  36.51 
 
 
448 aa  252  7e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  35.75 
 
 
452 aa  252  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1205  4-hydroxybenzoate transporter  41.15 
 
 
451 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0050  4-hydroxybenzoate transporter  41.15 
 
 
451 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0061  4-hydroxybenzoate transporter  41.15 
 
 
451 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586422  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1488  4-hydroxybenzoate transporter  41.15 
 
 
451 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  39.82 
 
 
455 aa  250  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  37.47 
 
 
458 aa  250  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  38.48 
 
 
458 aa  250  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6226  major facilitator transporter  36.42 
 
 
460 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  35.51 
 
 
452 aa  249  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 
447 aa  247  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  38.1 
 
 
449 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6628  major facilitator transporter  36.2 
 
 
460 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.990266 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6395  major facilitator transporter  36.2 
 
 
460 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0072  4-hydroxybenzoate transporter  40.71 
 
 
451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279221  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1558  4-hydroxybenzoate transporter  41.06 
 
 
451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0059  4-hydroxybenzoate transporter  41.06 
 
 
451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  37.32 
 
 
465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2625  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  36.47 
 
 
466 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000676448  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4528  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  36.47 
 
 
466 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000028085  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  37.47 
 
 
450 aa  243  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4011  protocatechuate (4-hydroxybenzoate) transmembrane transporter  38.57 
 
 
459 aa  243  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>