More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5722 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
433 aa  837    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  40.35 
 
 
433 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  39.85 
 
 
433 aa  277  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  39.85 
 
 
433 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  39.85 
 
 
433 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  39.85 
 
 
433 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  39.85 
 
 
433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  39.85 
 
 
436 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  39.85 
 
 
436 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  39.85 
 
 
433 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 
458 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  40.15 
 
 
455 aa  263  4.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  38.86 
 
 
454 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  38.21 
 
 
437 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  37.5 
 
 
454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  38.37 
 
 
436 aa  254  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  38.38 
 
 
454 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  40.94 
 
 
445 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  40.35 
 
 
451 aa  253  6e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  38.27 
 
 
442 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  37.53 
 
 
456 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 
444 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  37.41 
 
 
456 aa  243  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  36.72 
 
 
451 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3425  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 
436 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  36.49 
 
 
439 aa  239  9e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  37.05 
 
 
439 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  38.32 
 
 
446 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  37.1 
 
 
428 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 
450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  37.06 
 
 
455 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  36.41 
 
 
456 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1618  major facilitator transporter  36.67 
 
 
458 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  33.73 
 
 
450 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  33.88 
 
 
450 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  40.49 
 
 
443 aa  230  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1099  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  35.87 
 
 
461 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863734  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4011  major facilitator transporter  36.48 
 
 
435 aa  229  7e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.46849  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 
446 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  37.72 
 
 
448 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  37.98 
 
 
442 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  38.22 
 
 
440 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  38.07 
 
 
442 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  37.83 
 
 
442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  31.87 
 
 
452 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  38.7 
 
 
453 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  32.93 
 
 
452 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  38.7 
 
 
453 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  33.09 
 
 
452 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  38.44 
 
 
453 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  34.7 
 
 
446 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  34.25 
 
 
446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  38.34 
 
 
452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  38.34 
 
 
452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3237  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 
456 aa  209  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  37.11 
 
 
443 aa  208  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  33.98 
 
 
451 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  33.98 
 
 
451 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  33.98 
 
 
451 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  33.98 
 
 
451 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  38.61 
 
 
453 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  33.98 
 
 
451 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  33.98 
 
 
451 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3852  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 
446 aa  206  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000421805  normal  0.905597 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  33.98 
 
 
451 aa  206  9e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4137  major facilitator superfamily MFS_1  38.18 
 
 
460 aa  204  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6046  major facilitator transporter  33.42 
 
 
446 aa  202  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  35.5 
 
 
579 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  37.27 
 
 
450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0646  major facilitator superfamily MFS_1  36.5 
 
 
617 aa  199  7.999999999999999e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  36.6 
 
 
455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  33.82 
 
 
454 aa  196  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4045  major facilitator transporter  33.42 
 
 
421 aa  193  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6871  major facilitator transporter  35.63 
 
 
457 aa  187  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  33.94 
 
 
468 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 
454 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  35.92 
 
 
454 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  34.28 
 
 
461 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  30.4 
 
 
441 aa  176  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  30.56 
 
 
454 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  31.28 
 
 
449 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  34.46 
 
 
449 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  31.55 
 
 
475 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 
435 aa  169  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  31.66 
 
 
465 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1885  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 
454 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2054  major facilitator transporter  36.19 
 
 
454 aa  168  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 
447 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 
446 aa  167  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0623  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 
425 aa  166  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.456503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 
451 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  31.54 
 
 
459 aa  166  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  33.08 
 
 
441 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  31.74 
 
 
445 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  31.15 
 
 
438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4030  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 
463 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2604  major facilitator transporter  30.65 
 
 
467 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.792684  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5911  major facilitator transporter  31.33 
 
 
487 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 
452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2580  major facilitator transporter  30.65 
 
 
467 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>