More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4515 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  71.95 
 
 		 454 aa  650    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  100 
 
 		 454 aa  901    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  71.49 
 
 		 458 aa  648    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  70.57 
 
 		 439 aa  617  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  70.11 
 
 		 439 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  66.37 
 
 		 455 aa  586  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  71.03 
 
 		 456 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  69.63 
 
 		 448 aa  568  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1099  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  62.53 
 
 		 461 aa  554  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1618  major facilitator transporter  60.09 
 
 		 458 aa  501  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  56.56 
 
 		 456 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  55.46 
 
 		 452 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  57.24 
 
 		 456 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  55.23 
 
 		 450 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6046  major facilitator transporter  58.64 
 
 		 446 aa  478  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  55.01 
 
 		 452 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  55.68 
 
 		 450 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  56.04 
 
 		 455 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  52.29 
 
 		 451 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  48.36 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  52.41 
 
 		 443 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  51.24 
 
 		 440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  52.34 
 
 		 446 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  50 
 
 		 442 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  49.77 
 
 		 442 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  49.55 
 
 		 442 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  49.54 
 
 		 445 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  43.41 
 
 		 451 aa  354  2e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  43.52 
 
 		 446 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  42.83 
 
 		 446 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  42.83 
 
 		 446 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  45.65 
 
 		 443 aa  323  5e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  37.64 
 
 		 450 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  37.5 
 
 		 452 aa  319  6e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  39.47 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  39.47 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  39.2 
 
 		 433 aa  290  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  39.34 
 
 		 433 aa  289  8e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  39 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  39.11 
 
 		 436 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  39.11 
 
 		 433 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  39.2 
 
 		 433 aa  287  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  38.88 
 
 		 436 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  40 
 
 		 436 aa  278  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 		 435 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 442 aa  250  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  35.36 
 
 		 475 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 		 433 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 452 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 452 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 453 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 453 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  34.72 
 
 		 453 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  33.1 
 
 		 454 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 428 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 453 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 450 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 438 aa  226  7e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 437 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 447 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  34.64 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  34.34 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  34.12 
 
 		 455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  34.42 
 
 		 461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  34.34 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  34.34 
 
 		 451 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  34.34 
 
 		 451 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  34.34 
 
 		 451 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  34.34 
 
 		 451 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  33.78 
 
 		 445 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 449 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  34.4 
 
 		 448 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4011  major facilitator transporter  34.19 
 
 		 435 aa  213  7.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.46849  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 449 aa  210  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 453 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  34.63 
 
 		 448 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 454 aa  209  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 459 aa  209  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 465 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 453 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 453 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 454 aa  207  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 453 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  31.07 
 
 		 441 aa  207  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  36.48 
 
 		 461 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  34.35 
 
 		 454 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 444 aa  206  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  33.75 
 
 		 454 aa  207  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  33.41 
 
 		 579 aa  206  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  33.18 
 
 		 448 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3425  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 		 436 aa  205  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 453 aa  205  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  34.82 
 
 		 465 aa  204  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4030  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 		 463 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  33.03 
 
 		 451 aa  201  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  34.22 
 
 		 448 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 		 447 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3923  major facilitator superfamily transporter  36.93 
 
 		 462 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.603899  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  32.47 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  32.67 
 
 		 461 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>