More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2316 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
446 aa  905    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  44.32 
 
 
458 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  48.71 
 
 
443 aa  378  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  48.6 
 
 
451 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  47.54 
 
 
445 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  44.21 
 
 
439 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  44.21 
 
 
439 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  45.07 
 
 
446 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  41.99 
 
 
454 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  44.84 
 
 
454 aa  365  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  43.52 
 
 
454 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  43.83 
 
 
455 aa  358  8e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  43.97 
 
 
451 aa  354  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  39.82 
 
 
450 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  39.91 
 
 
450 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  42.41 
 
 
448 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  44 
 
 
440 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  41.48 
 
 
450 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  44 
 
 
442 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  44.24 
 
 
442 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  43.76 
 
 
442 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1099  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  40.72 
 
 
461 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863734  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  43.31 
 
 
456 aa  331  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1618  major facilitator transporter  43.1 
 
 
458 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  44.47 
 
 
443 aa  328  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  38.64 
 
 
452 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  37.61 
 
 
452 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  40.36 
 
 
456 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  39.46 
 
 
456 aa  316  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  42.55 
 
 
446 aa  316  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  37.08 
 
 
452 aa  317  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  42.31 
 
 
446 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  37.86 
 
 
436 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  37.86 
 
 
433 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  37.86 
 
 
433 aa  306  7e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  37.86 
 
 
433 aa  305  7e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6046  major facilitator transporter  40.7 
 
 
446 aa  305  7e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  37.86 
 
 
433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  37.62 
 
 
433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  37.86 
 
 
433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  37.62 
 
 
436 aa  301  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  37.62 
 
 
433 aa  300  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 
455 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  37.02 
 
 
436 aa  272  7e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  34.84 
 
 
441 aa  266  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  34.56 
 
 
442 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  35.01 
 
 
454 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 
435 aa  252  7e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  34.64 
 
 
428 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  35.23 
 
 
449 aa  246  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3425  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 
436 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  33.33 
 
 
437 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  32.42 
 
 
452 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  33.78 
 
 
459 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  32.56 
 
 
475 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  31.96 
 
 
451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  34.91 
 
 
447 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  31.34 
 
 
449 aa  233  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 
444 aa  233  7.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4011  major facilitator transporter  35.52 
 
 
435 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.46849  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  33.18 
 
 
453 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  31.72 
 
 
438 aa  230  4e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  35.5 
 
 
451 aa  229  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  33.04 
 
 
449 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  31.9 
 
 
468 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  33.18 
 
 
453 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  33.18 
 
 
453 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  32.95 
 
 
455 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  32.29 
 
 
452 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  32.29 
 
 
452 aa  226  7e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  33.71 
 
 
453 aa  226  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  33.78 
 
 
452 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  34.17 
 
 
452 aa  225  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  33.78 
 
 
452 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  32.88 
 
 
465 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  33.78 
 
 
453 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  33.56 
 
 
453 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  32.02 
 
 
453 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  31.89 
 
 
452 aa  223  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  31.9 
 
 
454 aa  222  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  32.41 
 
 
448 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 
447 aa  221  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  31.64 
 
 
452 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 
433 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  32.18 
 
 
448 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  32.16 
 
 
453 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  31.51 
 
 
452 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  33.5 
 
 
448 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  35.68 
 
 
441 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 
452 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  32.66 
 
 
449 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  33.33 
 
 
457 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  32.73 
 
 
446 aa  217  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  32.05 
 
 
461 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  31.18 
 
 
452 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  31.18 
 
 
452 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  31.18 
 
 
452 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  34.72 
 
 
450 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  32.48 
 
 
448 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  34.19 
 
 
451 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>