More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1181 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  100 
 
 
443 aa  865    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  64.61 
 
 
442 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  64.93 
 
 
442 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  64.71 
 
 
442 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  63.74 
 
 
440 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  60.14 
 
 
446 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  61.48 
 
 
443 aa  496  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  55.42 
 
 
451 aa  429  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  48.53 
 
 
454 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  50.46 
 
 
454 aa  421  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  51.76 
 
 
445 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  49.03 
 
 
455 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  48 
 
 
439 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  46.05 
 
 
458 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  48 
 
 
439 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  51.21 
 
 
456 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  47.53 
 
 
448 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  45.65 
 
 
454 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  44.72 
 
 
456 aa  361  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  45.06 
 
 
451 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1618  major facilitator transporter  45.74 
 
 
458 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 
446 aa  353  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  40.09 
 
 
450 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  40.09 
 
 
450 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1099  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  42.57 
 
 
461 aa  342  9e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863734  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6046  major facilitator transporter  44 
 
 
446 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  43.02 
 
 
456 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  40.23 
 
 
452 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  44.24 
 
 
446 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  39.77 
 
 
452 aa  319  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  43.57 
 
 
446 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  41.59 
 
 
453 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  42.13 
 
 
455 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  41.14 
 
 
453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  41.04 
 
 
453 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  41.14 
 
 
452 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  41.14 
 
 
452 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  36.71 
 
 
452 aa  289  6e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  37.95 
 
 
450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  40 
 
 
453 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  40.55 
 
 
455 aa  280  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  40 
 
 
450 aa  280  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  35.96 
 
 
438 aa  272  1e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 
435 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  37.53 
 
 
475 aa  264  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  39.09 
 
 
451 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  39.09 
 
 
451 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  39.62 
 
 
451 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  39.62 
 
 
451 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  39.62 
 
 
451 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  39.62 
 
 
451 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  38.36 
 
 
454 aa  260  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  39.09 
 
 
451 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  38.52 
 
 
442 aa  259  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  37 
 
 
437 aa  259  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  35.44 
 
 
436 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  35.44 
 
 
433 aa  249  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  35.44 
 
 
433 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  35.47 
 
 
433 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  35.44 
 
 
433 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  35.22 
 
 
436 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  39.04 
 
 
579 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  34.8 
 
 
433 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  34.71 
 
 
433 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  34.98 
 
 
433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  38.72 
 
 
465 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  36.47 
 
 
428 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  37.38 
 
 
451 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  34.25 
 
 
452 aa  240  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  34.03 
 
 
449 aa  239  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  36.61 
 
 
451 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  37.7 
 
 
453 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  37.53 
 
 
454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  37.84 
 
 
456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 
452 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  35.67 
 
 
454 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  35.56 
 
 
452 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  34.19 
 
 
441 aa  232  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  40.64 
 
 
441 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  35.56 
 
 
452 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 
454 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  34.81 
 
 
457 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  37.92 
 
 
452 aa  230  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  35.12 
 
 
452 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  36.2 
 
 
461 aa  230  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  35.36 
 
 
459 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  36.56 
 
 
444 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4011  protocatechuate (4-hydroxybenzoate) transmembrane transporter  37.65 
 
 
459 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  35.42 
 
 
436 aa  227  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  37.36 
 
 
453 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  38 
 
 
453 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  38 
 
 
453 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  35.59 
 
 
448 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6628  major facilitator transporter  34.35 
 
 
460 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.990266 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6395  major facilitator transporter  34.35 
 
 
460 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  33.63 
 
 
452 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6226  major facilitator transporter  34.14 
 
 
460 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  33.41 
 
 
452 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  33.41 
 
 
452 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  35.42 
 
 
453 aa  223  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>