More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2126 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 444 aa  856    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3852  major facilitator superfamily MFS_1  56.93 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000421805  normal  0.905597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4045  major facilitator transporter  48.25 
 
 		 421 aa  339  5e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  40.99 
 
 		 433 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  40.99 
 
 		 436 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  40.99 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  40.99 
 
 		 436 aa  290  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  40.63 
 
 		 433 aa  289  7e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  40.64 
 
 		 433 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  40.15 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  40 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  40.15 
 
 		 433 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 436 aa  264  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  36.14 
 
 		 454 aa  251  1e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0623  major facilitator superfamily MFS_1  38 
 
 		 425 aa  250  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.456503  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 437 aa  246  8e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  37.19 
 
 		 442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  36.61 
 
 		 428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 		 446 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  36.12 
 
 		 445 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 		 433 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  33.41 
 
 		 450 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 451 aa  229  8e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3425  major facilitator superfamily MFS_1  37.3 
 
 		 436 aa  229  9e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 450 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 		 458 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  31.97 
 
 		 454 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  37.38 
 
 		 446 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  36.87 
 
 		 446 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3237  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 456 aa  216  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  34.63 
 
 		 451 aa  216  9e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  35.18 
 
 		 456 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  33.65 
 
 		 439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  33.65 
 
 		 439 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  34.06 
 
 		 446 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 454 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  35.62 
 
 		 455 aa  210  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 452 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  34.89 
 
 		 442 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1618  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 458 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  34.64 
 
 		 442 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  34.64 
 
 		 442 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  36.49 
 
 		 443 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 456 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  34.64 
 
 		 440 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 443 aa  203  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  32.1 
 
 		 456 aa  203  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 		 450 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 		 455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4137  major facilitator superfamily MFS_1  38.31 
 
 		 460 aa  200  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0646  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 		 617 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 435 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6871  major facilitator transporter  35.83 
 
 		 457 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6046  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 446 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 		 447 aa  196  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  34.6 
 
 		 454 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  34.72 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 453 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 453 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4011  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 435 aa  190  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.46849  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1099  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.25 
 
 		 461 aa  189  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  34.68 
 
 		 451 aa  189  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  34.68 
 
 		 451 aa  189  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 450 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  34.37 
 
 		 451 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  34.37 
 
 		 451 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  34.37 
 
 		 451 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  34.37 
 
 		 451 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 449 aa  186  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  35.17 
 
 		 453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  34.2 
 
 		 451 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  30.38 
 
 		 452 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2054  major facilitator transporter  36 
 
 		 454 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  31.03 
 
 		 441 aa  180  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  34.52 
 
 		 579 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 446 aa  177  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  33.16 
 
 		 455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 452 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  35.26 
 
 		 449 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 454 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 447 aa  170  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 451 aa  170  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 449 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 459 aa  168  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 		 454 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  33.77 
 
 		 454 aa  167  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 468 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 451 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  35.42 
 
 		 446 aa  163  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  32.47 
 
 		 441 aa  163  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  31.27 
 
 		 448 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 452 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3364  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 		 463 aa  160  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  31.62 
 
 		 448 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  31.62 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>