More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0914 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  100 
 
 
434 aa  860    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  39.24 
 
 
480 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  39.24 
 
 
480 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  39.06 
 
 
480 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  39.06 
 
 
480 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  41.7 
 
 
478 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  39.24 
 
 
480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  39.32 
 
 
479 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  39.09 
 
 
467 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  38.3 
 
 
460 aa  301  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
459 aa  300  5e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  36.84 
 
 
463 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  37.39 
 
 
461 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4244  major facilitator transporter  37.9 
 
 
467 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  38.93 
 
 
467 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  38.93 
 
 
467 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0632  general substrate transporter  39.4 
 
 
471 aa  279  6e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000142658  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0909  major facilitator transporter  37.44 
 
 
455 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0703326  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1318  major facilitator family transporter  37.5 
 
 
468 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1490  major facilitator family transporter  36.92 
 
 
468 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0584  major facilitator family transporter  37.27 
 
 
474 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0308  major facilitator family transporter  37.27 
 
 
474 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2505  major facilitator family transporter  37.27 
 
 
468 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1325  major facilitator family transporter  37.27 
 
 
468 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68992  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1245  major facilitator family transporter  37.27 
 
 
468 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0983  major facilitator family transporter  37.27 
 
 
468 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4092  major facilitator transporter  38.41 
 
 
466 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4557  major facilitator transporter  38.72 
 
 
466 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00783301 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1116  major facilitator transporter  37.75 
 
 
466 aa  265  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.10577  normal  0.134 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5602  major facilitator transporter  37.75 
 
 
466 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.610871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3669  major facilitator transporter  37.75 
 
 
466 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4698  major facilitator transporter  37.75 
 
 
466 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.585046  normal  0.168682 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5071  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 
485 aa  259  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.706796  normal  0.279172 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3995  major facilitator transporter  38.5 
 
 
466 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0613817 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 
451 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  33.64 
 
 
457 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  32.65 
 
 
447 aa  212  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 
470 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  32.66 
 
 
456 aa  201  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.41 
 
 
468 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 
451 aa  192  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  31.29 
 
 
438 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  31.37 
 
 
455 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  31.25 
 
 
459 aa  187  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  28.25 
 
 
456 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 
465 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  30.74 
 
 
455 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 
451 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  30.2 
 
 
459 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  32.68 
 
 
473 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 
459 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  31.36 
 
 
464 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  32.84 
 
 
474 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  32.84 
 
 
474 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  32.84 
 
 
474 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  30.39 
 
 
399 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  30.79 
 
 
474 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.77 
 
 
472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  31 
 
 
478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  31.51 
 
 
476 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 
472 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  31 
 
 
478 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  31 
 
 
478 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  31 
 
 
478 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  31 
 
 
478 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  31 
 
 
478 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 
450 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  29.37 
 
 
399 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  30.79 
 
 
478 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  34.87 
 
 
435 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  29.14 
 
 
399 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 
398 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  32.68 
 
 
473 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 
447 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  29.37 
 
 
399 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  29.14 
 
 
399 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  29.14 
 
 
399 aa  170  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  29.14 
 
 
399 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  29.14 
 
 
399 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  31.29 
 
 
485 aa  170  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  33.04 
 
 
467 aa  170  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  28.9 
 
 
399 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  29.14 
 
 
399 aa  169  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  33.74 
 
 
477 aa  169  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  29.71 
 
 
482 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 
473 aa  168  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 
466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  30.89 
 
 
450 aa  167  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 
398 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 
444 aa  166  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  29.81 
 
 
430 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  31.49 
 
 
464 aa  164  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 
447 aa  163  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 
462 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 
445 aa  162  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  27.1 
 
 
399 aa  162  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 
479 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  29.5 
 
 
462 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  29.28 
 
 
462 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.61 
 
 
450 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>