More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6871 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6871  major facilitator transporter  100 
 
 		 457 aa  877    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3237  major facilitator superfamily MFS_1  84.19 
 
 		 456 aa  697    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0646  major facilitator superfamily MFS_1  53.42 
 
 		 617 aa  418  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4137  major facilitator superfamily MFS_1  54.97 
 
 		 460 aa  371  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  37.38 
 
 		 442 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 428 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 437 aa  244  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  33.64 
 
 		 433 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  34.22 
 
 		 436 aa  236  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  34.3 
 
 		 433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  34.06 
 
 		 433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  34.3 
 
 		 436 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  34.3 
 
 		 433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  34.13 
 
 		 433 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  34.13 
 
 		 433 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 433 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 436 aa  224  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 451 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  35.44 
 
 		 444 aa  223  7e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  36.79 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  36.16 
 
 		 442 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 442 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  37.3 
 
 		 451 aa  211  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 440 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  32.14 
 
 		 450 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 450 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 456 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3425  major facilitator superfamily MFS_1  35.95 
 
 		 436 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  35.73 
 
 		 455 aa  207  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 445 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  35.94 
 
 		 446 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  35.63 
 
 		 433 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 454 aa  203  5e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  30 
 
 		 452 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  35.02 
 
 		 443 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  36.69 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  32.17 
 
 		 454 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 458 aa  196  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 439 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 		 439 aa  192  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 454 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  33.41 
 
 		 456 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 443 aa  186  8e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 450 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4011  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.46849  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 456 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6046  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 446 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 455 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1099  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.69 
 
 		 461 aa  176  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1618  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 458 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4045  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 421 aa  170  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 450 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 448 aa  167  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 452 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 452 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 458 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 453 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 453 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  31.73 
 
 		 451 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  31.73 
 
 		 451 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  31.73 
 
 		 451 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  31.73 
 
 		 451 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  31.73 
 
 		 451 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  31.73 
 
 		 451 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 435 aa  160  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  31.73 
 
 		 451 aa  160  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  31.16 
 
 		 451 aa  156  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 452 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  30.43 
 
 		 454 aa  153  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  28.7 
 
 		 452 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  31.82 
 
 		 441 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3852  major facilitator superfamily MFS_1  32.94 
 
 		 446 aa  152  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000421805  normal  0.905597 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  32.74 
 
 		 454 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 452 aa  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 449 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 454 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 451 aa  150  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  29.85 
 
 		 475 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2054  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  31.58 
 
 		 579 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1885  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 454 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 459 aa  146  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 449 aa  146  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  30.81 
 
 		 455 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4030  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 		 463 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 447 aa  143  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0623  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 		 425 aa  144  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.456503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  33.92 
 
 		 461 aa  143  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 454 aa  142  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>