More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4137 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4137  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
460 aa  889    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3237  major facilitator superfamily MFS_1  55.1 
 
 
456 aa  411  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6871  major facilitator transporter  52.98 
 
 
457 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0646  major facilitator superfamily MFS_1  46.27 
 
 
617 aa  351  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  39.68 
 
 
442 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  39.18 
 
 
428 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  36.02 
 
 
437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  34.64 
 
 
433 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  35.4 
 
 
436 aa  249  6e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  34.41 
 
 
433 aa  247  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  34.41 
 
 
433 aa  246  6e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  33.94 
 
 
436 aa  246  8e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  34.18 
 
 
433 aa  246  8e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  34.18 
 
 
433 aa  246  9e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  34.17 
 
 
436 aa  246  9e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  34.4 
 
 
433 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  33.95 
 
 
433 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  36.09 
 
 
454 aa  244  3e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  39.27 
 
 
445 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  37.99 
 
 
444 aa  238  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  36.64 
 
 
446 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  33.94 
 
 
451 aa  233  5e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  32.59 
 
 
454 aa  229  9e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3425  major facilitator superfamily MFS_1  39.01 
 
 
436 aa  227  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  36.24 
 
 
451 aa  227  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  38.92 
 
 
433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 
458 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  36.34 
 
 
446 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  34.75 
 
 
456 aa  224  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  35.84 
 
 
455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4011  major facilitator transporter  35.01 
 
 
435 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.46849  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  35.02 
 
 
439 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  35.02 
 
 
439 aa  216  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  33.56 
 
 
454 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  36.05 
 
 
443 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  36.85 
 
 
443 aa  210  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  35.09 
 
 
442 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 
450 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  34.86 
 
 
442 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  34.63 
 
 
442 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  35.28 
 
 
440 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  36.29 
 
 
456 aa  205  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  34.6 
 
 
446 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  34.65 
 
 
448 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  35.03 
 
 
446 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  28.9 
 
 
452 aa  200  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1618  major facilitator transporter  33.33 
 
 
458 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  33.11 
 
 
456 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4045  major facilitator transporter  34.51 
 
 
421 aa  194  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  29.75 
 
 
450 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1099  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.97 
 
 
461 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863734  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  30.7 
 
 
452 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  29.57 
 
 
450 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  30.47 
 
 
452 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 
455 aa  186  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6046  major facilitator transporter  33.03 
 
 
446 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  32.16 
 
 
451 aa  183  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  32.16 
 
 
451 aa  183  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  31.92 
 
 
451 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  31.92 
 
 
451 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  31.92 
 
 
451 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  31.92 
 
 
451 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  32.16 
 
 
451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 
435 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  31.86 
 
 
453 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  31.86 
 
 
453 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3852  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 
446 aa  179  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000421805  normal  0.905597 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  31.63 
 
 
453 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  32.21 
 
 
452 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  32.21 
 
 
452 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  29.91 
 
 
451 aa  174  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0623  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 
425 aa  173  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.456503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  33.08 
 
 
453 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  32.82 
 
 
450 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  32.61 
 
 
579 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 
451 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2054  major facilitator transporter  35.06 
 
 
454 aa  172  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  29.74 
 
 
454 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  33.09 
 
 
449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  32.78 
 
 
468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  29.98 
 
 
446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  33.33 
 
 
475 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  32.68 
 
 
449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 
447 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  31.58 
 
 
458 aa  162  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  32.26 
 
 
455 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3364  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 
463 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  29.58 
 
 
454 aa  159  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  29.49 
 
 
438 aa  159  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  29.09 
 
 
454 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 
454 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  30.97 
 
 
448 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  32.16 
 
 
452 aa  157  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  31.24 
 
 
448 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  30.82 
 
 
454 aa  156  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  29.12 
 
 
452 aa  156  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  29.12 
 
 
452 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 
447 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  31.01 
 
 
448 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  28.67 
 
 
457 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>