More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3237 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6871  major facilitator transporter  84.19 
 
 		 457 aa  674    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3237  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 456 aa  878    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0646  major facilitator superfamily MFS_1  54.53 
 
 		 617 aa  433  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4137  major facilitator superfamily MFS_1  55.63 
 
 		 460 aa  385  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 442 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 428 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  33.41 
 
 		 433 aa  241  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  33.41 
 
 		 433 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  33.41 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 433 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  33.1 
 
 		 436 aa  240  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  33.1 
 
 		 433 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  33.41 
 
 		 433 aa  239  8e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 437 aa  239  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  33.18 
 
 		 436 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  32.71 
 
 		 433 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 451 aa  233  6e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  34.76 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 436 aa  227  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  36.8 
 
 		 446 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 		 433 aa  216  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 456 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  36.03 
 
 		 451 aa  212  9e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 454 aa  210  5e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3425  major facilitator superfamily MFS_1  34.24 
 
 		 436 aa  209  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 442 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 445 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  31.41 
 
 		 450 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 442 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 450 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 442 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 440 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  30.97 
 
 		 452 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  35.46 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 458 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  34.73 
 
 		 443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  35.71 
 
 		 446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  36 
 
 		 446 aa  199  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  33.67 
 
 		 454 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 439 aa  193  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  33.65 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 452 aa  190  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4011  major facilitator transporter  34.16 
 
 		 435 aa  189  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.46849  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 		 439 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 454 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 450 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 455 aa  183  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 443 aa  182  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6046  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 456 aa  179  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 448 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1099  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.9 
 
 		 461 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1618  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 458 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3852  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 		 446 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000421805  normal  0.905597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4045  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 421 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 453 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 453 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 452 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 452 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 435 aa  160  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 453 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  30.7 
 
 		 454 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 451 aa  156  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1885  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 454 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 452 aa  153  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  31.72 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  31.72 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 452 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 452 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 468 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  29.15 
 
 		 452 aa  152  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  31.72 
 
 		 451 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  31.72 
 
 		 451 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  31.72 
 
 		 451 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  31.72 
 
 		 451 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  31.72 
 
 		 451 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  32.36 
 
 		 458 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  32.55 
 
 		 454 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1556  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  31.02 
 
 		 451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2054  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 454 aa  146  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  30 
 
 		 452 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  30 
 
 		 452 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 459 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  30 
 
 		 452 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  30.26 
 
 		 475 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  30.3 
 
 		 441 aa  143  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0623  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.456503  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 449 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>