More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1556 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1556  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 432 aa  847    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  43.2 
 
 		 444 aa  324  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5127  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 447 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0417  major facilitator transporter  36.9 
 
 		 447 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4594  major facilitator transporter  36.9 
 
 		 447 aa  263  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.319083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3120  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 444 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3815  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 446 aa  246  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203479 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5692  major facilitator superfamily MFS_1  37.23 
 
 		 445 aa  246  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419889  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2023  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 446 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3740  major facilitator family transporter  37.53 
 
 		 446 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2166  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 446 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156507  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  32.64 
 
 		 454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  32.94 
 
 		 441 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1588  major facilitator transporter  35.84 
 
 		 410 aa  233  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.245234  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  35.32 
 
 		 458 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 453 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  32.8 
 
 		 455 aa  223  7e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 453 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  33.73 
 
 		 443 aa  222  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  32.02 
 
 		 475 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.89 
 
 		 452 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  30.28 
 
 		 448 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 438 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 448 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5626  MFS family transporter  35.96 
 
 		 487 aa  216  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441571  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  30.96 
 
 		 448 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 453 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 453 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  30.05 
 
 		 448 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  34.94 
 
 		 441 aa  213  7e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 		 451 aa  212  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 447 aa  212  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 465 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 449 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  30.47 
 
 		 448 aa  209  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 461 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7103  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 458 aa  209  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191279  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  31.36 
 
 		 458 aa  209  9e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 449 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 446 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 453 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 439 aa  206  8e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  29.18 
 
 		 447 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 447 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 439 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  29.73 
 
 		 448 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 449 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  33.25 
 
 		 454 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  32.25 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  30.37 
 
 		 451 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 453 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 450 aa  201  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 454 aa  201  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  30.37 
 
 		 451 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26060  sugar phosphate permease  32.04 
 
 		 445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  30.37 
 
 		 451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  30.37 
 
 		 451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  30.37 
 
 		 451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  30.37 
 
 		 451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 442 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  31.18 
 
 		 451 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  32.62 
 
 		 446 aa  200  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 442 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  32.39 
 
 		 452 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  32.39 
 
 		 452 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  32.33 
 
 		 452 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  32.39 
 
 		 452 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  30.63 
 
 		 579 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  29.24 
 
 		 448 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  31.69 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 440 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 456 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 452 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  30.96 
 
 		 465 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  30.11 
 
 		 454 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.8 
 
 		 461 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.46 
 
 		 465 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64790  putative MFS transporter  36.54 
 
 		 444 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 468 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  30.69 
 
 		 449 aa  196  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  31.43 
 
 		 452 aa  196  9e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2526  4-hydroxybenzoate transporter  32.07 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 453 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 443 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8635  major facilitator superfamily MFS_1  34.85 
 
 		 458 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0703703  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6046  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 450 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0804  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 432 aa  194  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>