More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1885 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1885  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
454 aa  909    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  46.31 
 
 
446 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  46.99 
 
 
447 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 
451 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  28 
 
 
451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  30.92 
 
 
447 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 
446 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  28.12 
 
 
454 aa  189  7e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 
435 aa  186  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  29.61 
 
 
454 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  28.02 
 
 
445 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 
458 aa  186  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 
450 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  27.11 
 
 
454 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  29.81 
 
 
456 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.54 
 
 
455 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  28.57 
 
 
456 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  27.99 
 
 
441 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  28.68 
 
 
452 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  28.19 
 
 
459 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  27.89 
 
 
455 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 
470 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  27.95 
 
 
399 aa  177  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  27.79 
 
 
459 aa  176  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 
473 aa  176  8e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 
451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  28.99 
 
 
449 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  29.76 
 
 
449 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  28.4 
 
 
461 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  27.71 
 
 
399 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  27.71 
 
 
399 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  27.71 
 
 
399 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.57 
 
 
452 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  27.04 
 
 
443 aa  171  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  29.81 
 
 
468 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 
447 aa  171  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  30.63 
 
 
438 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  27.39 
 
 
448 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  27.47 
 
 
399 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  27.23 
 
 
399 aa  170  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  28.86 
 
 
463 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  28.54 
 
 
452 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  27.92 
 
 
456 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  28.47 
 
 
455 aa  169  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  28.54 
 
 
452 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  27.23 
 
 
399 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  27.23 
 
 
399 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  27.23 
 
 
399 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  27.23 
 
 
399 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  29.82 
 
 
454 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  27.23 
 
 
399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  29.3 
 
 
464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  27.31 
 
 
460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  27.37 
 
 
442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  27.53 
 
 
453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  27.59 
 
 
453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  29.27 
 
 
450 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  26.9 
 
 
452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  25.06 
 
 
450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  29.41 
 
 
457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  26.9 
 
 
452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  26.61 
 
 
452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  27.9 
 
 
453 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 
456 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  27.55 
 
 
449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  27.15 
 
 
442 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  25.99 
 
 
450 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  26.93 
 
 
442 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  26.93 
 
 
440 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  26.87 
 
 
446 aa  163  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  26.95 
 
 
485 aa  162  9e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  29.49 
 
 
478 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 
455 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  26.38 
 
 
452 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.84 
 
 
468 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  26.9 
 
 
465 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  28.26 
 
 
450 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  27.27 
 
 
452 aa  160  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  28.41 
 
 
451 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  28.3 
 
 
453 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  28.41 
 
 
451 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 
451 aa  160  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  27.15 
 
 
454 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  30.37 
 
 
433 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  26.39 
 
 
451 aa  160  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  27.87 
 
 
446 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  28.41 
 
 
451 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  28.41 
 
 
451 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  27.16 
 
 
458 aa  159  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  28.41 
 
 
451 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  27 
 
 
459 aa  159  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  28.41 
 
 
451 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 
448 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  28.41 
 
 
451 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 
450 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  29.34 
 
 
433 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4356  major facilitator transporter  27.62 
 
 
447 aa  158  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  27.27 
 
 
465 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2604  major facilitator transporter  28.23 
 
 
467 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.792684  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>