More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1414 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  100 
 
 
468 aa  937    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  59.47 
 
 
456 aa  551  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  54.39 
 
 
456 aa  487  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  51.84 
 
 
470 aa  472  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  52.56 
 
 
465 aa  413  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  39.42 
 
 
447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 
451 aa  280  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  36.38 
 
 
455 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  37.11 
 
 
455 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  36.59 
 
 
459 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  35.18 
 
 
474 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  34.97 
 
 
474 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  35.71 
 
 
474 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  35.57 
 
 
473 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  37 
 
 
438 aa  259  8e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.81 
 
 
472 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  36.16 
 
 
457 aa  256  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  35.43 
 
 
476 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  35.47 
 
 
473 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  35.56 
 
 
474 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  34.81 
 
 
478 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  33.63 
 
 
472 aa  252  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  34.59 
 
 
478 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  34.59 
 
 
478 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  34.59 
 
 
478 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  34.59 
 
 
478 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  34.59 
 
 
478 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  34.59 
 
 
478 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 
473 aa  247  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 
451 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  35.86 
 
 
451 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  34.97 
 
 
399 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  35.43 
 
 
399 aa  240  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  34.27 
 
 
399 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  34.5 
 
 
399 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  34.27 
 
 
399 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  34.5 
 
 
399 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  34.5 
 
 
399 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  34.5 
 
 
399 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  34.5 
 
 
399 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  34.5 
 
 
399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  34.43 
 
 
485 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  33.57 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 
447 aa  233  5e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  35.18 
 
 
467 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 
435 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  35.98 
 
 
445 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  32.97 
 
 
459 aa  221  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  34.7 
 
 
398 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 
404 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 
398 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  33.19 
 
 
459 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  34.81 
 
 
477 aa  204  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 
473 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  28.79 
 
 
464 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.32 
 
 
487 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  33.62 
 
 
509 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  31.24 
 
 
488 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0909  major facilitator transporter  34.15 
 
 
455 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0703326  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  31.58 
 
 
460 aa  197  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  31.7 
 
 
424 aa  195  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  29.09 
 
 
492 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  33.16 
 
 
449 aa  193  5e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  29.87 
 
 
467 aa  192  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 
446 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  30.41 
 
 
434 aa  192  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 
447 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  29.62 
 
 
463 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.45 
 
 
468 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  32.34 
 
 
464 aa  188  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  31.77 
 
 
462 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 
466 aa  186  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  32.15 
 
 
462 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 
494 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  30.63 
 
 
430 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.38 
 
 
462 aa  183  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.36 
 
 
450 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  29.93 
 
 
472 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 
461 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 
467 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  30.15 
 
 
479 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.11 
 
 
470 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  29.57 
 
 
475 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 
459 aa  179  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  29.93 
 
 
479 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 
460 aa  179  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  29.87 
 
 
478 aa  179  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  31.06 
 
 
465 aa  179  9e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  29.57 
 
 
475 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  30.54 
 
 
472 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  29.35 
 
 
472 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  30.54 
 
 
472 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  29.58 
 
 
479 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  30.54 
 
 
472 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  30.32 
 
 
472 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  30.9 
 
 
381 aa  177  3e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.67 
 
 
461 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  30.32 
 
 
472 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
470 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  29.57 
 
 
472 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>