More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1660 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  100 
 
 
455 aa  879    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  94.95 
 
 
455 aa  834    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  79.47 
 
 
459 aa  684    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  73.14 
 
 
478 aa  624  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  72.91 
 
 
478 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  72.91 
 
 
478 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  72.91 
 
 
478 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  72.91 
 
 
478 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  72.91 
 
 
478 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  72.69 
 
 
478 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  70.27 
 
 
474 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  69.75 
 
 
473 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  70.2 
 
 
474 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  70.05 
 
 
474 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  71.4 
 
 
476 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  69.91 
 
 
474 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  67.76 
 
 
472 aa  591  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  69.13 
 
 
472 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  68.85 
 
 
467 aa  584  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  71.4 
 
 
473 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  62.56 
 
 
457 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  57.37 
 
 
451 aa  514  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  59.51 
 
 
451 aa  502  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  71.82 
 
 
398 aa  485  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  52.98 
 
 
514 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  45.21 
 
 
509 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  39.34 
 
 
447 aa  328  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  38.55 
 
 
451 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  38.17 
 
 
438 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 
456 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  36.85 
 
 
473 aa  275  9e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  39.56 
 
 
465 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.38 
 
 
468 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  34.87 
 
 
456 aa  266  8e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  36.56 
 
 
470 aa  263  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  36.38 
 
 
435 aa  256  7e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  35.11 
 
 
485 aa  255  9e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  37.27 
 
 
477 aa  255  1.0000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  33.41 
 
 
399 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 
398 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  33.03 
 
 
399 aa  249  9e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  33.72 
 
 
399 aa  249  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 
398 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  33.03 
 
 
399 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  33.03 
 
 
399 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  33.49 
 
 
399 aa  247  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  33.03 
 
 
399 aa  247  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  33.03 
 
 
399 aa  247  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  33.03 
 
 
399 aa  247  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  33.03 
 
 
399 aa  247  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  32.79 
 
 
399 aa  245  9e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  35.86 
 
 
449 aa  241  2e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  32.82 
 
 
459 aa  239  5.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
445 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 
447 aa  238  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  34.09 
 
 
437 aa  229  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  33.84 
 
 
459 aa  227  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  32.31 
 
 
438 aa  226  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  32.89 
 
 
464 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  33.94 
 
 
438 aa  226  9e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  32.96 
 
 
526 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 
404 aa  224  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  32.81 
 
 
436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 
462 aa  220  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  32.59 
 
 
436 aa  219  6e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  31.11 
 
 
463 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  33.74 
 
 
436 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  31.52 
 
 
460 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  36.09 
 
 
415 aa  206  6e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  37.15 
 
 
464 aa  206  6e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  37.75 
 
 
436 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 
466 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  32.97 
 
 
467 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.04 
 
 
450 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 
461 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 
459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  33.9 
 
 
437 aa  199  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 
473 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  33.63 
 
 
478 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1318  major facilitator family transporter  33.62 
 
 
468 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  31.12 
 
 
381 aa  195  1e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  34.62 
 
 
469 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  33.87 
 
 
469 aa  194  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
470 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1325  major facilitator family transporter  33.62 
 
 
468 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68992  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1245  major facilitator family transporter  33.62 
 
 
468 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.33 
 
 
461 aa  193  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0983  major facilitator family transporter  33.62 
 
 
468 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2505  major facilitator family transporter  33.62 
 
 
468 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0308  major facilitator family transporter  33.26 
 
 
474 aa  193  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0584  major facilitator family transporter  33.26 
 
 
474 aa  193  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 
446 aa  193  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.38 
 
 
468 aa  193  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 
447 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  32.2 
 
 
472 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0909  major facilitator transporter  33.84 
 
 
455 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0703326  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  31.91 
 
 
479 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  31.85 
 
 
475 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  31.35 
 
 
462 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.5 
 
 
462 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>