More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29790 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  100 
 
 		 485 aa  926    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  57.68 
 
 		 473 aa  487  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  61.46 
 
 		 435 aa  480  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  58.32 
 
 		 477 aa  462  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  58.81 
 
 		 445 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  61.41 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3242  major facilitator superfamily MFS_1  52.66 
 
 		 539 aa  442  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00325514  normal  0.76951 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  51.84 
 
 		 449 aa  395  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  44.12 
 
 		 447 aa  362  7.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  45.74 
 
 		 438 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  43.19 
 
 		 451 aa  354  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  44.24 
 
 		 398 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  42.98 
 
 		 398 aa  324  3e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  39.26 
 
 		 472 aa  292  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.55 
 
 		 472 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  39.28 
 
 		 473 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  39.36 
 
 		 474 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  39.36 
 
 		 474 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  39.36 
 
 		 474 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  35.76 
 
 		 451 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  40.21 
 
 		 473 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  35.65 
 
 		 459 aa  276  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 474 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  35.42 
 
 		 455 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 		 465 aa  268  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  35.15 
 
 		 455 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  39.09 
 
 		 478 aa  266  7e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  39.09 
 
 		 478 aa  266  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  39.09 
 
 		 478 aa  266  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  39.09 
 
 		 478 aa  266  7e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  38.88 
 
 		 478 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  38.88 
 
 		 478 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  38.88 
 
 		 478 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  37.08 
 
 		 476 aa  260  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 		 456 aa  257  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  37.82 
 
 		 467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  35.33 
 
 		 451 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  35.82 
 
 		 456 aa  250  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 457 aa  246  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  35.27 
 
 		 470 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 436 aa  244  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  38.92 
 
 		 464 aa  244  3.9999999999999997e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 509 aa  232  9e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  32.86 
 
 		 526 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 436 aa  229  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 382 aa  227  4e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  35.37 
 
 		 438 aa  226  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  35.84 
 
 		 436 aa  226  7e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  35.84 
 
 		 436 aa  226  7e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.83 
 
 		 468 aa  226  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 438 aa  226  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 514 aa  223  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 437 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 437 aa  206  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  36.74 
 
 		 398 aa  195  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 424 aa  192  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  31.49 
 
 		 464 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1266  major facilitator transporter  31.6 
 
 		 422 aa  189  7e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.693096  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  47.18 
 
 		 399 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  55.06 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1189  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 422 aa  188  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00252456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  55.06 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  47.45 
 
 		 399 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  33.91 
 
 		 469 aa  184  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  51.7 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  51.7 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  51.7 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  51.7 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  51.7 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  53.8 
 
 		 399 aa  182  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  53.8 
 
 		 399 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 422 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5470  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  44.76 
 
 		 404 aa  173  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  34.12 
 
 		 459 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 450 aa  172  7.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 473 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.8 
 
 		 468 aa  171  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 434 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 447 aa  170  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 462 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.36 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 450 aa  168  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.62 
 
 		 470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1885  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 454 aa  167  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 485 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  29.75 
 
 		 460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.49 
 
 		 461 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 492 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.49 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 446 aa  161  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 479 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 471 aa  160  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  30.44 
 
 		 463 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  28.86 
 
 		 476 aa  159  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>