More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4356 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4356  major facilitator transporter  100 
 
 		 447 aa  860    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3243  major facilitator transporter  58.21 
 
 		 448 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.12624 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  35.87 
 
 		 454 aa  243  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  36.11 
 
 		 452 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  36.34 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  38.19 
 
 		 458 aa  232  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  35.23 
 
 		 452 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  35 
 
 		 452 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  35.23 
 
 		 452 aa  229  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  35 
 
 		 452 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  31.97 
 
 		 441 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 449 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 449 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  31.71 
 
 		 451 aa  222  9e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  33.83 
 
 		 452 aa  221  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  34.22 
 
 		 448 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2526  4-hydroxybenzoate transporter  35.23 
 
 		 452 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 452 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.97 
 
 		 452 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  33.98 
 
 		 448 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  36.73 
 
 		 446 aa  216  8e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 468 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  33.98 
 
 		 448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  34.55 
 
 		 448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  38.17 
 
 		 441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 449 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 		 451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  32.87 
 
 		 455 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 447 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  34 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 449 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 457 aa  210  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 453 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 452 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 452 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 453 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 450 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2499  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 465 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2604  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 467 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.792684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  36.46 
 
 		 449 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0717  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 530 aa  207  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320017 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2580  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 467 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 453 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1969  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 467 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364305  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  34.33 
 
 		 457 aa  206  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2628  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 465 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 453 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  33.98 
 
 		 447 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1996  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 		 485 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.512683 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0708  4-hydroxybenzoate transporter, putative  33.41 
 
 		 464 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0289026  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  32 
 
 		 475 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 453 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 438 aa  203  4e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 452 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 453 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 453 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  35 
 
 		 453 aa  203  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6160  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 458 aa  203  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730505  normal  0.770759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 459 aa  202  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5911  major facilitator transporter  32.4 
 
 		 487 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  32.9 
 
 		 458 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  33.33 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  33.33 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  33.33 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  33.33 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  33.18 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  33.9 
 
 		 458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  33.11 
 
 		 451 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 448 aa  201  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  33.11 
 
 		 451 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  33 
 
 		 461 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2625  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  32.21 
 
 		 466 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000676448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4528  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  32.21 
 
 		 466 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000028085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 452 aa  199  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  33.11 
 
 		 451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3364  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 463 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 454 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 454 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0937  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 448 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.699917  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 447 aa  197  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 452 aa  197  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 452 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 452 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  34.39 
 
 		 448 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 452 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 452 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  33.9 
 
 		 448 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  32.81 
 
 		 465 aa  193  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 456 aa  193  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 449 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6499  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 449 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4011  protocatechuate (4-hydroxybenzoate) transmembrane transporter  31.44 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  32.28 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.07 
 
 		 465 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0891  major facilitator family transporter  34.06 
 
 		 484 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885088  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2484  putative 4-hydroxybenzoate transporter  34.06 
 
 		 484 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.750954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>