More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2604 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0717  major facilitator transporter  86.08 
 
 		 530 aa  778    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320017 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2604  major facilitator transporter  100 
 
 		 467 aa  905    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.792684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5911  major facilitator transporter  93.36 
 
 		 487 aa  822    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0708  4-hydroxybenzoate transporter, putative  80.32 
 
 		 464 aa  662    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0289026  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1996  major facilitator superfamily MFS_1  73.7 
 
 		 485 aa  647    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.512683 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1969  major facilitator transporter  99.57 
 
 		 467 aa  902    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364305  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2580  major facilitator transporter  99.57 
 
 		 467 aa  902    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2499  major facilitator transporter  93.36 
 
 		 465 aa  847    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2628  major facilitator transporter  92.72 
 
 		 465 aa  842    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2484  putative 4-hydroxybenzoate transporter  78.77 
 
 		 484 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.750954  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0891  major facilitator family transporter  78.77 
 
 		 484 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885088  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0097  major facilitator family transporter  78.77 
 
 		 484 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0077935  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0649  major facilitator family transporter  78.77 
 
 		 484 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0060403  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0894  major facilitator family transporter  78.34 
 
 		 484 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1052  4-hydroxybenzoate transporter  78.34 
 
 		 464 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0350  4-hydroxybenzoate transporter, putative  78.34 
 
 		 460 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6160  major facilitator transporter  70.71 
 
 		 458 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730505  normal  0.770759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3364  major facilitator superfamily MFS_1  64.96 
 
 		 463 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 449 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 449 aa  231  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  36 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  34.29 
 
 		 452 aa  223  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 465 aa  223  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 452 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 452 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  35.76 
 
 		 449 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  34.55 
 
 		 465 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 452 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  32.37 
 
 		 441 aa  217  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  35.62 
 
 		 452 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  34.99 
 
 		 452 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 452 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 452 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 454 aa  216  8e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4450  major facilitator transporter  35.86 
 
 		 460 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489654  normal  0.0331479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  35.84 
 
 		 454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  36.08 
 
 		 448 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 457 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 449 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  36.08 
 
 		 448 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  36.08 
 
 		 448 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  36.34 
 
 		 458 aa  211  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  35.38 
 
 		 448 aa  210  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  33.26 
 
 		 465 aa  209  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 450 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 454 aa  206  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  37.24 
 
 		 458 aa  206  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  34.33 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8635  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 		 458 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0703703  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  35.48 
 
 		 447 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  31.53 
 
 		 451 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 461 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  36.21 
 
 		 452 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  36.21 
 
 		 452 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  34.62 
 
 		 455 aa  203  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  36.21 
 
 		 452 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  35.96 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  34.29 
 
 		 475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4356  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  34.5 
 
 		 446 aa  201  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  35.37 
 
 		 448 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 449 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  35.35 
 
 		 448 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 455 aa  199  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  34.16 
 
 		 455 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  34.24 
 
 		 458 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3243  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 448 aa  195  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.12624 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  36.28 
 
 		 468 aa  194  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.24 
 
 		 452 aa  194  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 458 aa  193  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 447 aa  192  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3283  MFS family transporter  34.68 
 
 		 450 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170295  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  35.11 
 
 		 449 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  34.65 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3941  major facilitator transporter  35.21 
 
 		 449 aa  191  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.939508 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  35.8 
 
 		 451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 447 aa  190  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 458 aa  190  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 453 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 453 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 453 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  34.11 
 
 		 451 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2526  4-hydroxybenzoate transporter  36.21 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  34.11 
 
 		 451 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  34.93 
 
 		 449 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  34.11 
 
 		 451 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  34.11 
 
 		 451 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  34.11 
 
 		 451 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  34.11 
 
 		 451 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>