More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5312 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  79.54 
 
 		 454 aa  713    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  73 
 
 		 439 aa  636    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  72.82 
 
 		 455 aa  635    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  71.49 
 
 		 454 aa  648    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 458 aa  910    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  72.77 
 
 		 439 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  72.71 
 
 		 456 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  67.63 
 
 		 448 aa  588  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1099  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  61.98 
 
 		 461 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1618  major facilitator transporter  65.21 
 
 		 458 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6046  major facilitator transporter  62.62 
 
 		 446 aa  521  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  57.85 
 
 		 450 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  59.22 
 
 		 456 aa  519  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  62.02 
 
 		 455 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  57.62 
 
 		 450 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  56.99 
 
 		 452 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  57.11 
 
 		 452 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  57.24 
 
 		 456 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  51.82 
 
 		 454 aa  451  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  54.75 
 
 		 443 aa  440  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  54.38 
 
 		 451 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  54.57 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  52.25 
 
 		 442 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  52.03 
 
 		 442 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  53.29 
 
 		 440 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  52.25 
 
 		 442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  50.35 
 
 		 446 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  44.32 
 
 		 446 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  43.56 
 
 		 451 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  46.05 
 
 		 443 aa  344  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  40.28 
 
 		 452 aa  340  4e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 450 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  43.81 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  43.47 
 
 		 446 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  35.27 
 
 		 435 aa  302  9e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  40 
 
 		 433 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  39.51 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  39.51 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  39.52 
 
 		 436 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  39.52 
 
 		 433 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  39.76 
 
 		 436 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  40 
 
 		 433 aa  287  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 433 aa  288  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  39.27 
 
 		 433 aa  286  8e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  37.74 
 
 		 436 aa  264  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 453 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 453 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 452 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 452 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  33.63 
 
 		 454 aa  250  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 		 433 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 442 aa  246  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 453 aa  239  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 450 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 438 aa  233  5e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  36.94 
 
 		 465 aa  233  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 428 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  32.09 
 
 		 475 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  34.98 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 449 aa  226  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  32.18 
 
 		 455 aa  226  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 465 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  32.15 
 
 		 451 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  32.15 
 
 		 451 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  32.49 
 
 		 451 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  32.49 
 
 		 451 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  32.49 
 
 		 451 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  32.49 
 
 		 451 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  32.15 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 437 aa  221  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 454 aa  217  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  32.66 
 
 		 445 aa  216  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 449 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  33.33 
 
 		 461 aa  216  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  31.88 
 
 		 448 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  31.88 
 
 		 448 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 457 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  31.03 
 
 		 451 aa  212  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  32.47 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  29.6 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  31.57 
 
 		 448 aa  210  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 453 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 453 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  30.55 
 
 		 447 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3425  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 		 436 aa  208  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  31.76 
 
 		 579 aa  208  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.71 
 
 		 461 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 453 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  36.39 
 
 		 441 aa  207  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0937  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 		 448 aa  207  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.699917  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 459 aa  206  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 449 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  31.57 
 
 		 447 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  32.04 
 
 		 448 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 454 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 451 aa  205  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>