More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5623 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  100 
 
 		 446 aa  860    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  93.72 
 
 		 446 aa  780    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  50.67 
 
 		 451 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  47.17 
 
 		 451 aa  378  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  49.54 
 
 		 446 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  48.53 
 
 		 443 aa  363  4e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  48.17 
 
 		 445 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  46.49 
 
 		 455 aa  353  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  49.17 
 
 		 440 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  48.72 
 
 		 442 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  48.48 
 
 		 442 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  48.93 
 
 		 442 aa  346  6e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  44.68 
 
 		 439 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  42.83 
 
 		 454 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  41.36 
 
 		 454 aa  342  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 		 439 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  43.47 
 
 		 458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  44.02 
 
 		 448 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  41.72 
 
 		 454 aa  331  2e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  44 
 
 		 456 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  39.3 
 
 		 450 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  39.63 
 
 		 452 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  40.24 
 
 		 450 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 452 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  42.31 
 
 		 446 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  43.29 
 
 		 456 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 456 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1618  major facilitator transporter  42.47 
 
 		 458 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1099  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  41.16 
 
 		 461 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6046  major facilitator transporter  40.09 
 
 		 446 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  44.24 
 
 		 443 aa  299  7e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  37.09 
 
 		 433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  39.62 
 
 		 455 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  37.09 
 
 		 433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  36.84 
 
 		 433 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 433 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  37.09 
 
 		 433 aa  273  6e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  37.09 
 
 		 436 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  37.09 
 
 		 436 aa  272  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  36.84 
 
 		 433 aa  272  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  37.09 
 
 		 433 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  40.76 
 
 		 442 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  35.29 
 
 		 452 aa  266  7e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 450 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 436 aa  244  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  38.17 
 
 		 428 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 437 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  37.38 
 
 		 444 aa  230  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  37.71 
 
 		 454 aa  227  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  37.3 
 
 		 453 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  36.64 
 
 		 453 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  37.3 
 
 		 452 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  37.3 
 
 		 452 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 450 aa  223  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  37.62 
 
 		 453 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  36.99 
 
 		 453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 435 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 459 aa  216  8e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 		 451 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  35.1 
 
 		 475 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  35 
 
 		 465 aa  209  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  36.89 
 
 		 451 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  34.78 
 
 		 448 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  36.89 
 
 		 451 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  36.89 
 
 		 451 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  36.89 
 
 		 451 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  36.89 
 
 		 451 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  36.89 
 
 		 451 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 438 aa  208  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  36.89 
 
 		 451 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  33.86 
 
 		 451 aa  206  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  34.5 
 
 		 433 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 457 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  36.04 
 
 		 465 aa  204  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  35.02 
 
 		 455 aa  202  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  35.97 
 
 		 446 aa  202  9e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4011  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 435 aa  202  9e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.46849  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  36.41 
 
 		 454 aa  202  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 456 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3425  major facilitator superfamily MFS_1  34.6 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  34.32 
 
 		 448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  36.3 
 
 		 454 aa  199  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3852  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 		 446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000421805  normal  0.905597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  36.38 
 
 		 457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 449 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 447 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 452 aa  196  6e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  31 
 
 		 452 aa  196  9e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  36.16 
 
 		 453 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 447 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  36.8 
 
 		 579 aa  195  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.39 
 
 		 465 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 458 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 453 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  34.32 
 
 		 448 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  36.1 
 
 		 468 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  34.35 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  32.43 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>