More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1895 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  100 
 
 
451 aa  896    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  49.34 
 
 
446 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  50.67 
 
 
446 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  43.56 
 
 
458 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  47.65 
 
 
451 aa  363  3e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  42.92 
 
 
454 aa  363  4e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  47.34 
 
 
445 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  44.88 
 
 
439 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  43.41 
 
 
454 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  44.65 
 
 
439 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  44.25 
 
 
455 aa  346  5e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  46.77 
 
 
442 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  46.96 
 
 
446 aa  342  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  46.54 
 
 
442 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  43.97 
 
 
446 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  46.54 
 
 
442 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  47.94 
 
 
440 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  45.77 
 
 
443 aa  333  3e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  44.16 
 
 
448 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  41.89 
 
 
456 aa  329  6e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  41.72 
 
 
454 aa  328  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  39.73 
 
 
452 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  45.23 
 
 
456 aa  325  7e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  39.67 
 
 
450 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  40.68 
 
 
452 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  39.2 
 
 
450 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  45.14 
 
 
443 aa  319  7.999999999999999e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1618  major facilitator transporter  41.31 
 
 
458 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6046  major facilitator transporter  41.57 
 
 
446 aa  310  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  39.82 
 
 
456 aa  307  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1099  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  40.22 
 
 
461 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863734  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  41.39 
 
 
442 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  41.55 
 
 
455 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 
450 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  35.62 
 
 
452 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  39.47 
 
 
428 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  35.83 
 
 
437 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  36.54 
 
 
433 aa  261  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  36.71 
 
 
433 aa  259  7e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  36.25 
 
 
433 aa  259  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  36.06 
 
 
436 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  36.06 
 
 
436 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  36.06 
 
 
433 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  35.66 
 
 
433 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  35.66 
 
 
433 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  36.74 
 
 
433 aa  256  6e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  36.67 
 
 
436 aa  243  5e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  36.57 
 
 
453 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  36.57 
 
 
453 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  36.97 
 
 
453 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  36.32 
 
 
452 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  36.32 
 
 
452 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 
435 aa  236  7e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3425  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 
436 aa  236  8e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  35.24 
 
 
450 aa  233  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  36.72 
 
 
433 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  34.3 
 
 
444 aa  226  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  33.72 
 
 
454 aa  227  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  35.29 
 
 
453 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  34.68 
 
 
451 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  34.68 
 
 
451 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  34.68 
 
 
451 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  34.68 
 
 
451 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  34.68 
 
 
451 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  34.68 
 
 
451 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  32.71 
 
 
438 aa  219  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  34.68 
 
 
451 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  33.64 
 
 
455 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  32.53 
 
 
475 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  33.48 
 
 
449 aa  210  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 
451 aa  210  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  33.48 
 
 
459 aa  209  8e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3237  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 
456 aa  206  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  33.33 
 
 
447 aa  206  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  34.84 
 
 
456 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  34.79 
 
 
452 aa  205  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  34.46 
 
 
579 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 
447 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  31.77 
 
 
454 aa  203  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  34.34 
 
 
449 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  32.18 
 
 
449 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 
451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4011  major facilitator transporter  35.26 
 
 
435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.46849  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  33.11 
 
 
454 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  35.51 
 
 
446 aa  199  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  30.05 
 
 
465 aa  199  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4137  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 
460 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  33.56 
 
 
453 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1885  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 
454 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  30.79 
 
 
452 aa  196  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.57 
 
 
465 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  32.77 
 
 
451 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  33.09 
 
 
454 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  31.01 
 
 
452 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  32.81 
 
 
450 aa  193  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  33.89 
 
 
453 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20360  major facilitator superfamily (MFS) permease  32.55 
 
 
432 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 
444 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6871  major facilitator transporter  34.86 
 
 
457 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  33.89 
 
 
453 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>